文档介绍：福建师范大学
硕士学位论文
中国五个不同地理种群西施舌遗传多样性研究
姓名:王帅
申请学位级别:硕士
专业:动物学
指导教师:高如承;孟学平
20090501
摘要本研究采用随机扩增多态性⒑颂翘迥谧B技淝鴏和线粒体细胞色素氧化酶亚基分析方法,对我国西施舌福建长乐,江苏启东,江苏连云港蕉ń耗凸阄鞅海等五个群体遗传结构,多样性性状况和系统发育关系进行了分析和比较,主要研究结果如下:肦昙羌际酰直鸱治隽宋魇┥郈、和五个群体的遗传多样性及群体间的差异。在个随机引物中,筛选出个多态引物,对五个西施舌群体进行┰觯驳玫醮渲刑匾煨蕴醮继醮苁分比高达.%。条引物扩增所得片段大小在洌渲卸嗵点比例和香农指数分别为:.%、.%、.%、.%、.%和.,.;五个群体之间的遗传距离在.,,;群体与,,,涞囊糯ǚ只值直鹞.,.,欢鳴珿琒琇四个群体之间的遗传分化值..皇菹允綜禾搴推渌禾寮涞遗传分化最大,群体间的同样说明这一点。劾喾治鱿允荆篞蚐群体距离最近,首先聚为一支,然后该支和群体相聚后,再和禾逑嗑郏而群体则单独形成一支。贗晕甯鑫魇┥嗳禾宓囊糯ń峁埂⒁糯ǘ嘌越辛朔治觥扩增获得左右的核苷酸序列。锎炕笥隩载体连接,进行克隆、测序。。碱基组成分析显示:珻,琓平均含量分别为.%,.%,.%,.%,含量明显高于含量。遗传差异分析结果显示:群体和其它四个群体间的成对遗传距离%.%之间,遗传分化系数.;而另四个群体间的遗传距离在%.%之间,遗传分化系数为.—;以上数据表明,长乐群体和其它四个群体间亲缘关系较远,其余四个群体间无明显遗传分化。和劾嗤纪得髁苏庖坏恪魇┥郈蚐禾逡糯ǘ嘌缘腃分析:对线粒体蚱谓
了┰觯竦的核苷酸片段コ,两群体的含量分别为.%和.%,显著低于含量。基于腁分析表明,,%,%。基于法和法构建的系统数显示:所有的个体聚为一支,而个体聚为另一支。关键词西施舌,遗传多样性,,,福建师范大学王帅硕士学位论文Ⅱ
物,上游引物为疓瓽礼掠我镂’姗咖’,中砌序结果进行人工核对、校正。利用砑蠱砑信判颍中文文摘列为:,’,:’⒁糯ň嗬耄珿是我国海产贝类中的珍品,其肉质脆嫩,味甘美,具有较高的经济价值。由于过渡捕捞及环境污染等原因,西施舌自然资源锐减,无法满足市场需求。在此背景下,西施舌人工育苗大规模展开,并取得重大突破。但人工育苗可能会造成物种遗传多样性水平降低,种质资源退化,因此在育苗中进行基因监测是必要的。本文基于,和蛐蛄衅危芯砍だ⒘聘,启东,山东,广西北海西施舌五群体的遗传差异;确立群体分子遗传标记,分析其遗传多样性状况和系统发育,为西施舌人工繁殖中高品质亲本的选择提供可靠治觯禾崛∽蹹,电泳检测及定量分析后作为分析的模板备用,黜心序列见表由上海生工生物工程技术有限公司合成,每个群体取鲅綝进行跫呕I秆≡谌禾寮浠蛉禾迥诟鎏寮溆胁钜斓囊铩S蒙秆〕龅囊铮圆煌群体西施舌D0澹扛鋈禾迦鲅荆进行蒮觯琍产物用琼脂糖凝胶电泳分析,显色。凝胶成像系统拍照,记录电泳结果。根据电泳图谱进行分析,电泳结果按照条带的有无转化为嗾螅航ǖ缬就计字忻恳惶醮那ㄒ莆恢眉亲饕桓鑫点,当相同迁移位置的扩增带出现时记为笔Ъ俏。将谱带矩阵输入等相关参数计算及聚类分析。治觯禾崛『嘶蜃镈菹嘟诵蛄泻’序列保守设计引引物由上海生工合成,锞炕笥隩载体连接,进行克隆、测序。用砑分析各个Ⅱ序列的差异,采用双参数模型计算遗传距离,并分别用ā法构建系统树。用软件进行分子远咳禾宓囊糯ǚ只分析:提取不同群体西施舌总菹嘟諧序列设计引物,引物序’,引物由上海生工合成。蚱蜳扩增产物由上海西施舌的科学依据。变异分析
软件包中的计算单倍型数,应用珽删软件计算碱基组成。从表中可以看芯拷峁生工直接测序,用砑蠸圆庑蚪峁腥斯ず硕浴⑿U@肈软件包中软件进行排序,并通过遗传距离,采用距离矩阵,用。法以及非加权配对算数平均法菇ǖケ缎头肿酉低呈鳎低呈髦薪诘愕淖跃僦眯潘接τ米砸估计,次循环。用治龇椒ü浪阋糯ū湟煸谌禾迥诤腿禾寮涞姆植技耙糯ǚ只凳,并用排列测验法条引物对五群体体共个体进行了┰觥J笛榻峁允荆∮玫跻镌谖个地理群体中共扩增出个位点,、、、和禾宓任甯鋈禾宓亩嗵为:籗多态性信息指数的大小与各群体多态位点比例的大小趋势一致,这反映了在鋈禾迥诓康囊糯ǘ嘌灾浯嬖诓钜臁群体间的遗传距离显示,,;,;群体与,,,涞囊糯ǚ只值直鹞狾.,.,欢鳴珿琒琇四个群体之间的同样呈这一趋势。