文档介绍:广西师范大学
硕士学位论文
广西黑叶猴(Trachypithecus francoisi)遗传多样性研究
姓名:朱兵
申请学位级别:硕士
专业:生物化学与分子生物学
指导教师:黄乘明
20080501
广西黑叶猴(Trachypithecus francoisi)遗传多样性研究
作者姓名:朱兵指导老师:黄乘明教授周歧海副教授
学科专业:生物化学与分子生物学研究方向:分子生态学年级:2005 级
中文摘要
黑叶猴(Trachypithecus francoisi)为灵长目(primates)猴科(ceropithecidae)疣猴
亚科动物,主要分布在中国和越南,为世界濒危和国家一级保护动物。广西作为
黑叶猴在中国的主要分布区之一,黑叶猴的数量在近 30 年急剧下降,栖息地破
碎化十分严重,保护形势不容乐观。深入了解黑叶猴各地理种群的分子变异及遗
传水平现状,可以为黑叶猴保护提供重要的依据。本文以黑叶猴的粪便为实验材
料,以线粒体 DNA 分子标记为研究对象,对采自广西和贵州的 145 个粪便样品
(其中 142 个样品来自广西的龙州,大新,隆安,扶绥 4 个县)的线粒体 DNA
控制区的部分序列的一级结构进行测定,依据测序结果对广西黑叶猴的遗传结构
进行初步分析,并对采样和实验工作中遇到的一些问题进行了初步探讨。主要研
究结果如下:
(1)本次实验共使用了 145 个样品,最后有 110 个样品的测序结果可以用于
分析研究,黑叶猴的粪便样品的扩增成功率为 %。
(2)本次分析的广西黑叶猴样品的 mtDNA D-loop 的长度为 395bp,并且有
16 种单倍型,43 个变异位点。
(3)在广西 4 个黑叶猴地理种群中,龙州(GX-LZ)种群的单倍型和多态位
点最多,单倍型间核苷酸差异平均数最大。
(4)在大空间尺度上,来自贵州和广西的黑叶猴单倍型严格聚类,但在小
空间尺度上,来自各县的单倍型在系统树中呈镶嵌分布。
(5)通过对全部单倍型进行网络关系分析,我们发现各单倍型间的变异位
点数为:1-32 个。
我们建议:龙州县黑叶猴种群携带的遗传信息较为丰富,为了能更好的保护
黑叶猴的基因多态性,应将龙州县的黑叶猴种群列为最优先保护的单元;讨论迁
地保护的可行性,加强种群间的基因交流。
关键词:黑叶猴(Trachypithecus francoisi) 粪便分子生物学线粒体 DNA
控制区(D-loop) 遗传结构变异位点
I
The Study on ic Diversity of the Francois Langur (Trachypithecus francoisi)
in Guangxi province,China
Auther:Zhu Bing Supervisor: Professor Huang Chengming
Associate Professor Zhou Qihai
Majority: biochemistry and molecular biology Direction: molecular ecology
Grade:2005
Abstract
Francois Langur (Trachypithecus francoisi) has been defined the First-Class
National Protected Species in China and Endangered-Class in the distributes
restrictedly in the southwest of China and northern Vietnam. Guangxi province is one
of the main distribution area of the Francois Langur in China,but their habitat
fragmentation seriously destroy and the population size declines every quickly in
understanding the morphologicaland molecular variation of
different geographic group of Francois Langur is every important for us designing
con