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碱裂解法原理染色体DNA比质粒DNA分子大得多.pptx

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碱裂解法原理染色体DNA比质粒DNA分子大得多.pptx

上传人:wo1230 2020/12/25 文件大小:364 KB

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碱裂解法原理染色体DNA比质粒DNA分子大得多.pptx

文档介绍

文档介绍:核酸的提取及鉴定
核酸是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,因此核酸的提取是分子生物学实验技术中最重要、最基本的操作 。
一、核酸的分类
DNA (脱氧核糖核酸)
主要存在于细胞核的染色体中。
核外也有少量DNA,如线粒体DNA(mtDNA),叶绿体DNA(cpDNA),质粒DNA。
RNA(核糖核酸)
存在于细胞质中,如mRNA, rRNA, tRNA等。
除上述DNA,RNA外,还有非细胞形式存在的病毒和噬 菌体,其或只含DNA,或只含有RNA。
二、DNA提取的几种方法
(一) 非基因组DNA的提取
质粒DNA的提取
碱裂解法
煮沸法
线粒体、叶绿体DNA的提取
差速离心结合SDS裂解法
质粒DNA-碱裂解法
碱裂解法原理
染色体DNA比质粒DNA分子大得多,且染色体DNA为线状分子,而质粒DNA为共价闭合环状分子;
当用碱处理DNA溶液时,线状染色体DNA容易发生变性,共价闭环的质粒DNA在回到中性pH时即恢复其天然构象;
变性染色体DN***段与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀,而复性的超螺旋质粒DNA分子则以溶解状态存在液相中,从而可通过离心将两者分开。
质粒DNA-碱裂解法
碱裂解法流程图
对数期菌体
溶液III中和
溶液I充分重悬
溶液II裂解
上清液
抽提
离心洗涤
酒精沉淀
干燥溶解
沉淀
质粒DNA溶液
质粒DNA-煮沸法
煮沸法原理
染色体DNA比质粒DNA分子大得多,且染色体DNA为线状分子,而质粒DNA为共价闭合环状分子;
当加热处理DNA溶液时,线状染色体DNA容易发生变性,共价闭环的质粒DNA在冷却时即恢复其天然构象;
变性染色体DN***段与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀,而复性的超螺旋质粒DNA分子则以溶解状态存在液相中,从而可通过离心将两者分开。
(二)基因组DNA的提取- CTAB法
CTAB法原理
CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三***溴化铵),是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,并与核酸形成复合物。
该复合物在高盐溶液中(> NaCl)是可溶的,通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。
注:CTAB溶液在低于15℃ 时会形成沉淀析出,因此在将其加入冰冷的
植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15℃。
CTAB提取缓冲液的经典配方
组份
Tris-HCl ()
EDTA ()
NaCl
CTAB
β-巯基乙醇
终浓度
100 mM
20 mM

2%(W/V)
%(V/V)使用前加入
Tris-HCl ()提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;
NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中;
CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;
β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除
(二)基因组DNA的提取- CTAB法
CTAB提取缓冲液的改进配方
组份
Tris-HCl ()
EDTA ()
NaCl
CTAB
PVP40
β-巯基乙醇
终浓度
100 mM
20 mM

3%(W/V)
5%(W/V)
2%(V/V)使用前加入
PVP(聚乙烯吡咯烷***)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。
(二)基因组DNA的提取- CTAB法