文档介绍:C enter of C omputational C hemistry 并行计算机与并行计算并行计算机与并行计算张鑫理论与计算化学国际合作研究中心分子反应动力学国家重点实验室 C enter of C omputational C hemistry 情况介绍分子反应动力学国家重点实验室交叉分子束动力学课题组理论与计算化学国际合作中心研究员 2人,其中一位为中国科学院院士,高级访问学者 1人,博士后研究人员 6人, 博士研究生 18 人,硕士研究生 4人与多个国际学术团队有很好的合作,与纽约大学化学系张增辉教授合作建立理论与计算化学国际合作研究中心 C enter of C omputational C hemistry 主要研究工作实验方面: 交叉分子束对光解,碰撞反应,立体化学动力学的研究激光诱导荧光方法对光解,立体化学动力学的研究飞秒激光对超快动力学过程的研究理论方面: 准经典轨线方法对反应动态学的研究量子力学方法对反应动态学的研究复杂体系势能面的构造,拟和量子化学及其他方法对分子结构,物质特性,化学反应过程的研究 1997-2001 年,发表文章 84篇,其中英文 66篇 C enter of C omputational C hemistry HPC Server C enter of C omputational C hemistry 并行计算机与并行计算 1为什么要建造并行计算机 2并行计算机的类型 3什么是并行计算,并行进程的特性及并行模型的分类 4工作站集群(COW) 的基本结构 5中国科学院十五计划中关于并行计算部分 C enter of C omputational C hemistry 为什么要建造并行计算机 C enter of C omputational C hemistry 什么是超级计算环境超级计算( puting ), 从技术的意义上说,是为了在问题的求解上具有更快的速度、更高的精度、更大的规模、更好的性能价格比而采用的非主流计算的设施和方式。 C enter of C omputational C hemistry 计算速度的要求?问题: 科学和工程问题的数值模拟与仿真–计算密集–数据密集–网络密集–三种混合?要求:在合理的时限内完成计算任务–秒级制造业–分钟级短时天气预报(当天) –小时级中期天气预报(3~10 日) –尽可能快长期天气预报(气候) –可计算湍流模拟 C enter of C omputational C hemistry 问题的规模全球气候变化图1-1 系统速度天气预报 72小时油藏建模机翼设计物体特性分析年后 1995 1991 1980 1988 1993 存储器容量 48 结构生物学药物设计化学动力学 1000GB 100GB 10GB 1GB 100MB 10MB 小时天气预报 100Mflops 1Gflops 10Gflops 100Gflops 1Tflops 人类基因湍流飞行动力学海洋环流粘滞流体动力学超导建模半导体建模视觉量子染色动力学 3维等离子体建模C enter of C omputational C hemistry 计算机的规模: TOP10 (2001 年7月) 排名制造商计算机 R max 使用单位, 地点国家制造年份应用领域处理器数 1 IBM ASCI White, SP Power3 375 MHz 7226 Lawrence Livermore National Laboratory Livermore USA 2000 Research Energy 8192 2 IBM SP Power3 375 MHz 16 way 2526 NERSC/LBNL Berkeley USA 2001 Research 2528 3 Intel ASCI Red Sandia National Labs, Albuquerque USA 1999 Research 9632 4 IBM ASCI Blue - Pacific SST, IBM SP 604e 2144 Lawrence Livermore National Laboratory, Live rmore USA 1999 Research Energy 5808 5 SGI ASCI Blue Mountain 1608 Los Alamos National Laboratory, Los Alamos USA 1998 Research 6144 6 IBM SP Power3 375 MHz 1417 IBM/Naval Oceanographic Off