基于全基因组和转录组分析的赤芝密码子使用偏好性比较研究.pdf

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基于全基 因组和转 录组 分析 的赤芝密码子使 用偏好性 比较研究
朱孝轩 什，朱英杰 ”，宋经元，孙 超，陈士林，
．中 国医学科 学院、北京协和 医学院药用植物研 究所，北京 ；
．中国 中医科 学院中药研 究所，北 京
摘要 ：密码子使 用偏好性 是物种在 遗传信 息传递过 程中 的一个重 要特点，分析物种 的密码子 使用偏 好性对
于 了解该物种遗 传信 息的传递规律 具有重要 意义 。原有 的密码子 偏好性 分析主要基 于全基 因组数据完 成，然而
由于 目前可获 得的高等生物全基因组数据有限，使得密码子偏好性分析受 到了极大的限制 。本研 究通过分析 赤芝
『日口 ： 全基 因组 及其液体培养 菌丝、原基和子实体大规 模转录组数据 ，发现基
于全基 因组和转录 组数据分析 获得 的所有 氨基酸 的最优 密码 子完全 一致 。以上研 究结 果表 明，利 用大规模 转录
组数据代替基 因组数据分析物种