文档介绍：蛋白质组学导论 --生物学的新工具
前言
在后基因时代,生物学家正在对基因组的功能进行研究。蛋白质组学是生物技术的最新领域,它将对基因组功能的研究作出巨大贡献。
本课程主要介绍了分析蛋白质和肽的各种方法,重点阐述了不同质谱仪及相关算法的基本原理和使用方法,详细描述了质谱在蛋白质组学的应用。
课程总纲
第一章蛋白质组学和新生物学
第二章蛋白质组
第三章分析蛋白质组学概述
第四章蛋白质和肽的分析分离
第五章蛋白质消化技术
第六章分析蛋白质和肽的质谱仪
第七章用肽质量指纹谱鉴定蛋白质
第八章用串联质谱仪分析肽序列
第九章用串联质谱数据进行蛋白质鉴定
第十章 SALSA:一种采集串联MS数据特征的算法
第十一章采集蛋白质组
第十二章蛋白质表达谱
第十三章鉴定蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质复合物
第十四章蛋白质修饰谱
第十五章蛋白质组学的新方向
第一章蛋白质组学和新生物学
新生物学
蛋白质组学
蛋白质组学的必要性
蛋白质组学对分析的挑战
蛋白质组学的工具
蛋白质组学的应用
第一节新生物学
蛋白质组学的发展
蛋白质组学是研究与基因相对应的蛋白质组的学科。术语“蛋白质组学”(proteomics)和“蛋白质组( proteome)是Marc wilkins及其同事在20世纪90年代早期提出的,对应于描述生物中全部基因的术语“基因组学”(genomics)和“基因组”(genome)()。
DNA→基因组“基因组学”
↓
mRNA
↓
蛋白质→蛋白质组“蛋白质组学”
↓
细胞功能
基因组学和蛋白质组学的生物化学关系
二形成新生物学基础的三项进展
、表达序列标签(EST)和蛋白质序列数据库的发展。做为许多生物基因的部分信息库,这些资源很有价值。
、基于浏览器的生物信息学工具。利用这些工具从上述数据库中获取信息。
。微阵含有在玻片上或芯片上的一系列基因专一性寡核苷酸或cDNA序列。将感兴趣样品的DNA混合物荧光标记后与微阵进行杂交,可以一次探测几千个基因的表达()。
三微阵
微阵带来的重要变化是使生物学家进行“宏观”思考。细胞有成千上万的以不同组合方式进行的基因表达。细胞的生死是由这些基因的表达和其蛋白质产物的活性决定的。
每种蛋白质所表达的功能只有在同一细胞内其他蛋白质的功能和活性同时表达时才有意义。因此生物学家正在努力做宏观思考,去理解系统而不是理解组分,寻求复杂性的意义。