文档介绍：广东海洋大学
硕士学位论文
南海笛鲷属几种鱼类的分子系统学研究
姓名:徐田军
申请学位级别:硕士
专业:水产养殖
指导教师:刘楚吾
20060601
南海笛鲷属几种鱼类的分子系统学研究摘要采用聚合酶链式反应际醵岳帐系仰簟⒔鹧娴仰簟⒑祺⒌仰簟⒆虾斓仰簟画眉笛鲷、星点笛鲷、约氏笛鲷、千年笛鲷和金带笛鲷的的部分基因片段进行了扩增。锎炕缶璗载体连接进行克隆、测序,序列结果编辑后提交⒒竦眯蛄械锹己拧1榷院蟮玫搅擞行Сざ任的序列,、%、.ズ%,含量稍高于含量,值仰糁碱基组成差异不大。利用~软件检测到单碱基突变位点个,变异位点个,其中包括信息位点个,在变异位点中.%的碱基替换是由于发生了转换,转换和颠换比为。经过计算发现在值仰糁欣帐系仰艉徒鹧娴仰簟⒗帐系仰艉徒鸫仰的亲缘关系最近,碱基差异为ィ欢祺⒌仰艉徒鹧娴仰簟⒑祺⒌仰艉突嫉仰的距离则明显较大,碱基差异达到了ァ@貌獾眯蛄蟹直鸸菇薔蚆肿系统树,选用高体长棘鲷为外群发现两种方法构建的系统树基本一致:红鳍笛鲷和千年笛鲷首先聚在一起作为独立的一枝分化出来,紫红笛鲷和约氏笛鲷聚为一小枝后与其他志墼谝黄稹W芴謇纯闯祺⒌仰艉颓甑仰艚辖猓渌镏旨渚3至艘欢ǖ囊传距离,没有非常近的现象,这也说明了在南海海域的这九种笛鲷仍保持了自己的遗传特性。对勒氏笛鲷、金焰笛鲷、红鳍笛鲷、紫红笛鲷和画眉笛鲷的区进行了扩增,纯化产物后转入靥褰锌寺『退虿庑颍蛄薪峁峤籊并获得序列号。各物种序列长度差异很大,最长的勒氏笛鲷的长度为鹧娴仰艚鑫」艹ざ炔钜旌艽螅瞧浼罨槌扇疵挥泻艽蟮牟畋稹、、%、.ズ%,含量远远超过含量。经过比对发现插入或缺失位点共觯湟煳坏个,其中信息位点为觥T诒湟煳坏阒%的碱基替换是发生了转换。转换颠换比值为,这一比值远远低于正常蛄械比值。根据双参数和单参数两种模型计算的值仰舻募罨钜於己艽螅话愣荚%以上,勒氏笛鲷和金焰笛鲷碱基差异为喽越闲。祺⒌仰艉妥虾斓仰糇小为J褂明阄M馊汗菇ǖ腘蚆低呈骰旧弦恢拢豪帐系仰艉徒鹧娴鲷聚为一枝,红鳍笛鲷和紫红聚为一枝,而画眉笛鲷作为独立的一枝出现。这和利用相对保守的序列构建的系统树基本上一致。此外,本文还利用技术对上述值仰艚辛顺醪椒治觥J褂猛ㄓ靡風和从总芯┰龀鲈的猙片段,利用电泳分别从勒氏笛鲷、
金焰笛鲷、红鳍笛鲷、紫红笛鲷和画眉笛鲷中检出了帧种、帧种和只因型。在值仰糁谢嫉仰舻囊糯ǘ嘌宰罡撸嵫娴仰舻南喽越闲关键词:笛鲷属,—,,,分子系统学,遗传多样性
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砖担。陵名研究生签名:缘矽享广东海洋大学学位论文独创性及知识产权声明本人声明所呈交的论文是我本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得本校或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。本学位论文成果归广东海洋大学所有。指导教师签名年月日’
第一章生物多样性及其遗传多样性研究方法生物多样性研究的内容及其重要。广东海洋大学硕士学位论文生物资源是全人类赖以生存的物质基础,它给人类提供衣食住行的物质条件,改善人类的生存和生态环境,与人类的生存息息相关。但是由于人类活动的扩展,人口的急剧膨胀,对各种生物资源的需求迅速增加,起全球环境的逐步恶化,并导致越来越多的物种遭到破坏,许多物种已经灭绝。因此,保护生物多样性的问题已经同益成为整个国际社会广泛关注的热点问题。在这一点上,各国政府和科学家达成共识,大力支持丌展遗传多样性的研究,研究各种生物的起源,功能,以及发展和维持等方面的基础性工作,以实现对生物资源的科学管理和可持续发展利用。生物多样性是指一定空间范围内多种多样活的有机体有规律的综合在一起的总称【】。这包括物种内、物种之间和生态系统的多样性。不同的学者对此有不同的定义,但是一般来说生物多样性是指地球上所有生物铩⒅参铩⑽⑸锏所包含的基因以及由这些生物与环境相互作用所构成的生态系统的多样化程度。它涵盖所有不同种类的动物、植物、微生物及其所拥有的基因以及与生存环境形成的复杂的生态系统。生物多样性是人类生存和发展的基础,它表现在生命系统的各个组织水平,从分子、基因到生态系统乃至整个人类社会,不仅直接提供人类生活所必须的各种食物、药物、纤维、建筑材料,还通过参与各种生物地球化学循环过程来维持人类生存所必需的生存环境吲。生物多样性可分为遗传多样性、物种多样性和生态系统多样性三个层次渲猩低扯嘌允侵干锛捌生存环境所构成的综合