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捕食性圆盘菌科无性属分子系统发育及分类学研究.pdf

文档介绍

文档介绍:南开大学博士研究生毕业学位论文中文摘要
中文摘要
从云南、天津和香港的不同生态环境中共分离到种捕食线虫真菌。包括
弯抱节丛抱、少抱节丛抱、圆锥节丛抱
、爪哇节丛抱蠕虫状节丛抱、多抱节丛抱
、厚皮单顶抱、奇妙单顶抱、多头节丛
抱、柱捕单顶抱“、中华单顶抱
附胞隔指抱、椭圆单顶抱、坚粘抱单顶抱
、坚菌丝单顶抱啊句指状节丛抱和长袍
指等。
对个食线虫真菌节从抱属、隔指抱属和单顶抱属菌株和个其他相
关丝抱菌顶辐抱属和单端抱属菌株的片段进行了扩增,并用限制性
内切酶对产物进行了消化。采用法
对产物的限制性图谱特征进行了聚类分析结果表明,捕食性真菌的聚类
群与捕食器官类型相对应,顶辐抱属和单端抱属与捕食性真菌的遗传距离较远。
对食线虫真菌的个属和及其相
关属和共种的
个菌株的端约片断进行了测序,分别采用
和法构建了系统发育树个抽样分析
支持捕食性圆盘菌科的无性属构成单系群。无性属单系内又聚类为个与捕食结
构相对应的系统发育分支,但这些分支的统计支持率未达到单系水平。这些分支
包括粘性菌网群、粘性分枝群、粘球
群、收缩环群和不捕食的种类群
。根据系统发育分析的结果,将捕食性圆盘菌科的无性属合并为一个
订正属一节丛饱属,包括个新组合亚属隔指抱亚属
群、节丛饱亚属群,杜掘亚属
群、指球霉亚属群
和掘氏霉亚属群。进一步再将节从饱亚
属叼分为束梗抱组、节丛抱组
和单顶抱组。提出了个新组合种。总计订正
并接受了个种,排除了个可疑种。
根据系统发育分析的结果,在捕食性圆盘菌科无性属分支与有性
属分支的节点上,进化树是完全决定的和二歧式的,这表明捕食线虫真菌起源于包
括在内的圆盘菌科。捕食性圆盘菌科无性属分支是多歧式的,一个节点含
南开大学博士研究生毕业学位论文中文摘要
有个或个节间辐射,不同的捕食器官类型的几个聚类群不能单立为单系,这表
明的杂种祖先群体在短时间内分化为两个以上聚类群。因此捕食性圆盘菌
科无性属的不同捕食器官类型聚类群起源于杂种祖先群体的短时间辐射
创门在进化上是平行的,没有演化的先后。
关键词分子进化,食线虫真菌,,圆盘菌科,捕食器官,
南开大学博士研究生毕业学位论文英文摘要




,及












南开大学博士研究生毕业学位论文英文摘要
南开大学博士研究生毕业〔学位论文绪论
第一章绪论
真菌系统发育的研究概况
自和开创了利用核普酸序列研究水生真菌之间
的相互关系以来,核酸序列的比较研究使进化真菌学的面貌发生了革命性变化。
随着真菌系统发育研究的进展,真菌界的内涵发生了很大改变。原先放在真菌界
的两群细胞型粘菌集胞菌门,网柄菌门,合胞体粘菌根肿菌纲,和真菌型管毛
生物卵菌门,丝壶菌门和网粘菌门已被独立出来。真菌界包括壶菌门、接合菌门、
担子菌门和子囊菌门。壶菌和接合菌的几个代表种的系统发育分析揭示出两个门
之间的物种交叉,壶菌门和接合菌门的名称己失去了实际意义,因此将这两类真
菌合称为多核真菌。鞭毛和壶菌的系统发育学还揭示,不能依据共同的祖先特征
一鞭毛的有或无来确定单系群,即鞭毛不具有系统发育信息。系统发育揭示出担
子菌门和子囊菌门较近的进化关系,两门的多数种为单核菌丝,但交配后核融合
延迟,形成一个双核期故合在一起称为双核真菌。根据基因的系统发
育分析,担子菌门分为三个单系群,锈菌纲、黑粉菌纲和层菌纲。子囊菌门的一
些传统分类阶元如不整子囊菌纲和核菌纲证明是单系群,而另外一些则不是单
系群如盘菌纲和腔菌纲
真菌系统发育研究包括两个方面的内容,一方面是对目前系统树的理解和应
用,另一方面是如何构建和评价系统树。
真菌的系统发育树
地球化学及微化石证据表明,生命可能在亿年以前就已经出现在地球上。
现代分子生物学的成果之一是地球生命之树的构建所有现存
生物系统发育树的根位于原核生物,它包括两个主要谱系细菌超界及古细菌超
界和真核生物超界的祖先图。通常认为这两个谱系的分歧发生在亿年以
前,根据核糖体基因的比较,真核生物约在亿年以前从古细菌谱系中分离出来,
随后通过内共生作用从细菌中获得了线粒体图。真核生物的进化表现为许
多“原生动物”阶元的有序分歧,约在亿年以前以更复杂真核生物的辐射而达
到顶点, 即树冠的分支辐射图。
真核生物超界基部的分支,如消化道寄生的贾第斯虫和微袍子虫早在获得线
粒休之前就分歧出来。随后分歧出集胞菌门原生质粘菌门
和网粘菌门图
繁殖形态学和鞭毛精细结构的研究,真菌赖氨酸合成途径和细胞壁多糖的研究
以及真菌类群的核酸序列比较研究表明真菌单系群四个门所构成的真菌界和