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上传人:学习好资料 2021/11/24 文件大小:736 KB

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文档介绍

文档介绍:·8· 国际移植与血液净化杂志 2021年 3月第 19卷第 2期 InternationalJournalofTransplantationandHemopurification2021,Vol.19,No.2 
·基础研究·
基于生物信息学分析筛选参与肾脏
纤维化的关键基因和通路
姜秋竹 杨会 张兴娜 周晓霜
  【摘要】 目的 寻找肾脏纤维化发生的关键基因和潜在机制,为肾脏纤维化早期诊断和治
疗提供评估手段和新思路。方法 在基因表达综合数据库(GEO数据库)中进行搜索找出信息
芯片 GSE102515,筛选出差异基因,找出下调基因和上调基因。通过 DAVID数据库对肾脏纤维
化发展过程中的差异基因进行富集分析,利用 STRING数据库和 Cytoscape软件分析差异基因,
进行可视化处理。结果 筛选出 27个上调基因和 322个下调基因。差异基因主要参与整合素
介导的信号通路、有丝分裂姐妹染色单体结合等,差异基因分子功能主要为磷脂结合、调控区
DNA结合等,差异基因细胞组分主要与低密度脂蛋白颗粒、核等相关。筛选发现 ADM、ARRB1、
AVPR2、CCR1、MTNR1A、PTH、S1PR2是肾脏纤维化风险相关蛋白相互作用网络中的核心基因。
结论 通过对数据集进行分析,筛选出肾脏纤维化发生过程中的差异基因,发现 ADM、ARRB1、
AVPR2、CCR1、MTNR1A、PTH、S1PR2可能为肾脏纤维化发展过程中的重要参与者,为寻找有价
值的肾脏纤维化标志物提供了数据分析支持。
【关键词】 肾脏纤维化; GEO数据库; 关键基因; 蛋白互作网络
Bioinformaticsanalysisofkidneyfibrosisrelatedgenes JiangQiuzhu,YangHui,ZhangXingna,
ZhouXiaoshuang.TheAffiliatedPeople’sHospitalofShanxiMedicalUniversity,Taiyuan030012,
China
Correspondingauthor:ZhouXiaoshuang,Email:xiaoshuangzhou66@163.com
  【Abstract】 Objective Tofindthekeygenesandpotentialmechanismsofrenalfibrosis,and
providenewideasforearlydiagnosisandtreatmentofrenalfibrosis.Methods WesearchedtheGEO