文档介绍：高通量测序常用名词科普
高通量测序常用名词科普
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高通量测序常用名词科普
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高通量测序常用名词汇总
一代测序技术：即传统的Sanger 测序法， Sanger 法是根据核苷酸在待定序列模板上的引物
点开始，随机在某一个特定的碱基处终止，并且在每个碱基后面进行荧光标记，产生以A、
T、C、G结束的四组不同长度的一系列核苷酸，每一次序列测定由一套四个单独的反应构成，
每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP) ，并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷
酸(ddNTP) 。由于 ddNTP缺乏延伸所需要的 3-OH 基团，使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、
A、 T 或 C 处终止，使反应得到一组长几百至几千碱基的链终止产物。它们具有共同的起始
点，但终止在不同的的核苷酸上， 可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段，通过
检测得到DNA碱基序列。
二代测序技术： next generation sequencing（ NGS）又称为高通量测序技术，与传统测序
相比，二代测序技术可以一次对几十万到几百万条核酸分子同时进行序列测定，从而使得对
一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序（Deep
sequencing ）。NGS主要的平台有Roche（ 454 & 454+），Illumina （ HiSeq 2000/2500 、GAIIx 、
MiSeq）， ABI SOLiD 等。
基因： Gene，是遗传的物质基础，是DNA或 RNA分子上具有遗传信息的特定核苷酸序列。基
因通过复制把遗传信息传递给下一代，使后代出现与亲代相似的性状。
DNA：Deoxyribonucleicacid ，脱氧核糖核酸，一个脱氧核苷酸分子由三部分组成：含氮碱
基、脱氧核糖、磷酸。脱氧核糖核酸通过 3',5'- 磷酸二酯键按一定的顺序彼此相连构成长链，即 DNA链， DNA链上特定的核苷酸序列包含有生物的遗传信息，是绝大部分生物遗传信息的载体。
RNA：RibonucleicAcid ，，核糖核酸，一个核糖核苷酸分子由碱基，核糖和磷酸构成。核糖
核苷酸经磷酯键缩合而成长链状分子称之为类病毒中的遗传信息载体。 不同种类的白质生物合成的 RNA有信使 RNA、转移
RNA链。 RNA是存在于生物细胞以及部分病毒、
RNA链长不同， 行使各式各样的生物功能，如参与蛋
RNA和核糖体RNA等。
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16S rDNA："S" 是沉降系数 ，是反映生物大分子在离心场中向下沉降速度的一个指标，值越
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高，说明分子越大。 rDNA（ ribosome DNA）指的是原核生物基因组中编码核糖体RNA（rRNA）
分子对应的 DNA序列， 16S rDNA 是原核生物编码核糖体小亚基16S rRNA的基因。细菌 rRNA
（核糖体 RNA）按沉降系数分为 3 种，分别为 5S、 16S 和 23S rRNA。16S rDNA 是细菌染色
体上编码 16S rRNA相对应的 DNA序列，存在于所有细菌染色体基因中。16S rRNA 普遍存在
于原核生物中。 16S rRNA 分子，其大小约1540bp，既含有高度保守的序列区域，又有中度
保守和高度变化的序列区域， 其可变区序列因细菌不同而异，恒定区序列基本保守，所以可
利用恒定区序列设计引物，将 16S rDNA 片段扩增出来，通过高通量测序利用可变区序列的差异来对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。
cDNA：complementary DNA，互补脱氧核糖核酸，与 RNA链互补的单链DNA，以 RNA为模板，
在反转录酶的作用下所合成的DNA。
Small RNA：生物体内一类高度保守的重要的功能分子，其大小在 18-30nt ，包括 microRNA、
siRNA、snRNA、 snoRNA和 piRNA（ piwi-interactingRNA）等，它的主要功能是诱导基因沉
默，调控细胞生长、发育、基因转录和翻译等生物学过程。以miRNA为例介绍它们的功能：
miRNA与 RNA诱导沉默复合体（ RNA induced silencing complex, RISC）结合，并将此复
合体与其互补的 mRNA序列结合，根据靶序列与 miRNA的互