文档介绍：什么叫单细胞基因测序（Single Cell Sequencing）？
一句话说，就是单个细胞水平上对基因组进行测序。
2013年，Nature杂志把年度技术授予了单细胞基因测序（Single Cell Sequencing）,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。
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单细胞基因组、转录组分析
单细胞测序通过对单个细胞进行基因组扩增和测序
解决了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规测序的难题
研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向
为早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。
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基因组及转录组分析中常遇到的难题：
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全基因组和全转录组分析的难题：
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单细胞测序应用领域
单细胞全基因组测序：
1、体外受精的胚胎测序：在把胚胎植回母体之前，先取一个细胞进行测序，确认基因正常后再植回，以保障胚胎是正常的。
2、CTC细胞测序：通过对血液中的肿瘤细胞测序，找到突变位点，针对性能进行靶向药物治疗。
3、肿瘤亚细胞群测序：肿瘤发生、发展中，细胞不断发生新的突变，形成许多亚细胞群，单细胞测序可以对这些亚细胞群进行分别的测序，并找到对应的治疗方案。
4、免疫测序：免疫细胞在对抗原发生识别后，免疫细胞的基因组发生重排，并产生对抗原特异的抗体。对免疫细胞的测序，可以找出特异的基因结构。
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单细胞测序应用领域
单细胞转录组测序：
1、在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的肿瘤细胞、干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。
2、发现亚细胞成分的基因表达谱，例如对在神经元的轴突或树突部分特异表达的基因的转录组分析。
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一、单细胞测序行业
BCC Research的一项分析报告指出，2014年全球单细胞分析（Single-cell Analysis），，复合增长率达21%。根据GENReports的报告，关于单细胞分析的文章发表在过去的几年也有着爆发性的增长。
图2：单细胞分析的文章发表数量
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二、单细胞基因测序的基本流程：单细胞分离--基因组扩增--测序和分析
单细胞测序，主要经过如下的步骤：
单细胞的分离
DNA/RNA的提取和扩增（全基因组扩增和全转录组扩增）
测序以及后续的分析和应用
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 单细胞的捕捉和分离
单细胞测序的第一步是单细胞的分离和提取，目前的方法主要有：
流式细胞术
激光捕获显微切割技术
微流控技术
Daniel A. Haber, et al CANCER DISCOVERY JUNE 2014
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单细胞操作的仪器
Fluidigm C1单细胞操作
毛细管显微操作单细胞
10X Genomics
Illumina与Bio-Rad发布Singel-Cell Sequencing Solution
QIAscout
武汉友芝友-CTC捕获仪
强生-Cell Reserch
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