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康成生物全基因组表达谱芯片技术服务
康成生物为您提供全基因组表达谱芯片技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,康成的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作,并提供完整的实验报告。实验结果。
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Agilent全基因组表达谱芯片
Agilent公司的原位喷墨专利技术〔SurePrint〕可以实现在1"x 3"的玻璃片基上灵活地、大规模地原位合成60mer的寡核苷酸探针,该技术可以很快很灵活地响应并实现最新的芯片探针设计方案,使研究者与时得到高质量的、最新的芯片,作为研究基因表达变化的利器。
每个芯片探针的设计除了经过软件考虑其Tm、二级结构、序列特异性等之外,还都要经反复实验筛选优化以得到灵敏度和准确度更高、重复性更好的结果。2006年美台评估报告MAQC中,Agilent array 的结果与 Taqman array 结果的重复性最高。在国际论文期刊上,也有很多利用Agilent array 平台发表的高质量文章,具体请参阅Agilent 。
目前提供的芯片有人、小鼠、大鼠的全基因组表达芯片,每个物种覆盖的基因超过41000个,探针设计综合参考了各种公共数据库,是经过实验验证的经典设计方案。
Agilent
Design ID
Array format
Genes coverage
Database source
Whole human genome
14850
4 x 44K
~41,000
Goldenpath, Ensembl, Unigene, Human Genome (Build 33), Refseq, GebBank
whole mouse genome
14868
4 x 44K
~41,000
USC mRNA known genes, Natl. Institute on Aging, Genbank, Unigene, Refseq, Ensembl, RIKEN
whole rat genome
14879
4 x 44K
~41,000
Ensembl, UCSC Goldenpath, Unigene, Refseq, Genbank
Agilent 芯片技术示意图
A. 客户提供实验组〔Exp〕、对照组〔Control〕样本或Total RNA;
B. 使用Nanodrop测定RNA 在分光光度计260nm 、280nm和230nm的吸收值,以计算浓度并评估纯度;
C. cDNA放大与荧光标记,实验组〔Cy5〕,对照组〔Cy3〕;
D. 进展芯片杂交与洗脱等步骤;
E. 进展图像扫描与数据分析。
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NimbleGen全基因组表达谱芯片
NimbleGen公司运用光介导合成专利技术生产高密度DNA芯片,其探针为50-80mer的长寡核苷酸,在单X玻璃基片上包含385,000个探针,这些长寡核苷酸探针在高严谨杂交条件下可得到高灵敏度与高特异性的无以伦比的理想实验结