缺齿甲胁虱线粒体基因组测序与分析 孙佳宁.pdf

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中国寄生虫学 孙佳宁，陈婷，董文鸽 *
【摘要】 目的 对缺齿甲胁虱线粒体基因组序列进行测定与分析 了解甲胁虱属线粒体基因组的结构特征
袁
和变异情况 方法 在大理苍山世界地质公园捕获大绒鼠 全捕法采集大绒鼠体表吸虱 鉴定后选取缺齿甲胁
遥 袁 袁
虱用组织 提取试剂盒提取单只缺齿甲胁虱 用通用引物扩增缺齿甲胁虱的 rrnS 和 rrnL 基因的短片段序
DNA DNA遥
列 测序后在短片段序列的保守区设计特异引物 扩增包含 rrnS 和 rrnL 基因的全长或近乎全长的微环染色
袁 袁 PCR
体 微环染色体组装成功后在其保守区设计一对微环染色体编码区特异性引物 扩增出全部微环的编码区
袁 袁 PCR 遥
扩增产物纯化后进行高通量测序法测序 利用 等生物信息学工具分析其线
遥 Geneious尧 tRNAscan尧 CodonW尧 BLAST
粒体基因结构特征与变异情况 结果 共获得缺齿甲胁虱优质序列读数 组装后共找到节肢动物
遥 6812606bp遥
线粒体基因组常见基因 个 包括 个蛋白质编码基因 个 基因和 个 基因 缺齿甲胁
24 袁 7 渊PCG冤尧 15 tRNA 2 rRNA 遥
虱线粒体基因组裂化为 个微环染色体 登录号 这些基因不均匀地分布在微
8 渊GenBank 院 MW835203~MW835210冤袁