文档介绍:: .
基因组学与应 及普通高粱品种的泛基因组,大小为 908 Mb,比单个参考基因组增加约 %,进行了核心
以及非核心基因、基因组存在/缺失变异(PAVs )区域相关基因的分类统计及功能富集分析,
对多样本多个时期的 NAR - seq 数据进行差异表达分析,构建基因共表达网络,对基因集进
行筛选验证,进一步筛选得到了糖分相关基因;(2)利用 12 份不同时期的甜高粱 Rio)( ,
非甜高粱 BTx( 406) 以及两者子代 88(R) 91 的 eqRNA -s 数据进行不同时期差异表达分析与
基因共表达分析,通过与对应时期蔗糖浓度变化数据进行相关性分析,得到与蔗糖代谢相关
的基因集。研究成果有助于揭示甜高粱及非甜高粱糖分差异原因,为高粱品种改良及育种相
关研究提供借鉴。
关键词 甜高粱;高粱;基因共表达网络;转录组
Multi-omics analysis of sweet sorghum and sorghum
(Sorghum bicolor)
Dong-Xin Wang1, Jia-Ming Song1, Ling-Qiang Wang2, Ling-Ling Chen1, *
1 State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, College
of Life Science and Technology, Guangxi University, Nanning, 530004
2 College of Agriculture, Guangxi University, Nanning, 530004
*Corresponding author, ******@
Abstract Sorghum (Sorghum bicolor) is an annual herb of the Poaceae family and a model
organism for the study of C4 plants. Compared with ordinary sorghum, sweet sorghum has a unique
基金项目:本项目由国家自然科学基金(31871269)资助
引用格式:Wang ., Song ., Wang ., Chen ., Multi-omics analysis of sweet sorghum and sorghum
(Sorghum bicolor),Genomics and Applied Biology,(王东欣,宋佳明,王令强,陈玲玲,甜高粱与高粱的多组
学比较分析,基因组学与应用生物学)
1mechanism of sugar metabolism and accumulation. Discovering the regulatory genes and metabolic
pathways related to sugar synthesi