1 / 33
文档名称:

lammps多机集群并行配置.doc

格式:doc   大小:2,042KB   页数:33页
下载后只包含 1 个 DOC 格式的文档,没有任何的图纸或源代码,查看文件列表

如果您已付费下载过本站文档,您可以点这里二次下载

分享

预览

lammps多机集群并行配置.doc

上传人:儒林 2022/7/17 文件大小:1.99 MB

下载得到文件列表

lammps多机集群并行配置.doc

相关文档

文档介绍

文档介绍:lammps多机集群并行配置
2
多机并行运算配置设置步骤
第一步、安装Linux
在WinXP存在的前提下安装Linux双系统
在Win XP下右击“我的电脑”>管理>磁盘管理
右击D右击>删除
选中“保存文件”选项,
点击“确定”按钮
下载的文件名称为:lammps-
3、下载mpich2
/
7
点击“mpich2-(stable release) MPICH2 [http] 22MB”这一行中的“[http]”
选中“保存文件”选项
点击“确定”按钮
下载的文件名称为:mpich2-
4、下载fftw

点击“FFTW ”目录下的“·http:fftw- (http:fftw-)()”中的“fftw-”,即可打开下载链接
选中“保存文件”选项
点击“确定”按钮
下载的文件名称为:fftw-
注意:下载的四个压缩包
Python-

mpich2-
fftw-
将会保存到root里的“下载”文件夹中,将它们拷贝粘贴至桌面上的“root的主文件夹”下。
8
第三步、更新Linux的Python
在集群的每台机器上都需要完成本步骤的操作。
如果不更新,将会使得mpd & 出错
双击桌面上的“root的主文件夹”,在文件夹内部单击鼠标右键,选择“在终端中打开”,
tar xvf Python- (输入文件名称时,先写开头几个字母,点击Tab键可以自动补全文件全称)
cd Python-
./configure回车
make回车
sudo make install回车
鼠标点击当前终端窗口右上角的“关闭”,关闭当前的终端,
鼠标点击“root文件夹”窗口右上角的“关闭”,关闭“root文件夹”。
9
第四步 设置环境变量
在集群的每台机器上都需要完成本步骤的操作。
1、双击桌面上的“root的主文件夹”
鼠标点击菜单中的“查看”,选中“显示隐藏文件”
在文件夹内部单击鼠标右键,选择“在终端中打开”
cd ~
vi .bashrc回车
敲Insert键
2、.bashrc中的所有命令行用以下内容替换:
# .bashrc
# User specific aliases and functions
alias rm=’rm -i’
alias cp=’cp -i’
alias mv=’rm -i’
#source global definitons
10
if [ -f /etc/bashrc ]; then
. /etc/bashrc
fi
export PATH=/opt/mpich/bin:/opt/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich/lib:/opt/fftw/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export MPI_USEP4SSPORT=yes
export MPI_P4SSPORT=22
export P4_RSHCOMMAND=ssh
3、Esc(保存),Shift+z+z(退出),
鼠标点击当前终端窗口右上角的“关闭”,关闭当前的终端,
鼠标点击“root文件夹”窗口右上角的“关闭”,关闭“root文件夹”。
4、重要:点击菜单“系统”,点击“关机”,点击“重启”,重启计算机,使改动的环境变量生效。
重启后,鼠标点击“其它…”,
11
在“用户名”后输入root回车,
在“密码”后输入123456回车。
12
第五步 ssh配置
1、修改所有机器上的/etc/hosts文件,在里面添加参与计算的ip地址和机器名,具体操作为:
在桌面上鼠标双击“计算机”,双击“文件系统”,双击其中的“etc”文件夹,在文件夹内部单击鼠标右键,选择“在终端中打开”
cd /
cd etc
当前路径是******@localhost etc,
vi hosts回