1 / 5
文档名称:

单细胞测序技术在胃癌研究中的应用.pdf

格式:pdf   大小:1,151KB   页数:5页
下载后只包含 1 个 PDF 格式的文档,没有任何的图纸或源代码,查看文件列表

如果您已付费下载过本站文档,您可以点这里二次下载

分享

预览

单细胞测序技术在胃癌研究中的应用.pdf

上传人:湘云 2022/7/18 文件大小:1.12 MB

下载得到文件列表

单细胞测序技术在胃癌研究中的应用.pdf

相关文档

文档介绍

文档介绍:临床检验杂志 2022 年 3 月第 40 卷第 3 期  Chin J Clin Lab Sci,Mar. 2022,Vol.40,No.3 ·229·
DOI:10.13602 / j.cnki.jcls.2022.03.15 GC 患者和 1 例肠道上皮化生(GIM)患者
[18]
Tang 等 首次使用单细胞转录组测序(single cell RNA 中获取组织,对其进行单细胞转录组分析,结果发现与正常
Seq,scRNASeq)技术在单个小鼠卵母细胞和卵裂球进行分 胃组织相比,同一种类型的细胞具有异质性。这种异质性
析,随后经过不断优化,包括单细胞 mRNA 深度测序文库构 在肿瘤内和肿瘤间均存在,如巨噬细胞具有转录异质性,不
建方法、提高测序通量等,使得单细胞转录组测序能够适用 符合 M1 / M2 型巨噬细胞;细胞毒性 T 细胞(CTL)内具有肿
于更多研究中。诸如单细胞标记反转录测序(singlecell 瘤耗竭 T 细胞型亚组等。此外,该学者通过单细胞测序和
[1920]
tagged reverse transcription sequencing,STRTseq) 、模板 受体配体相互作用分析了 TME 专有的细胞间通讯,有助于
转换法(switching mechanism at 5′end of the RNA transcript, 了解肿瘤生物学,对筛选 GC 的潜在免疫治疗靶点具有重要
[7]
SMARTseq) 、体外线性(IVT)扩增单细胞转录组的方法 价值。
(cell expression by linear amplification and sequencing,CEL GC 的发展过程是从非萎缩性胃炎到慢性萎缩性胃炎,
[17]
seq) 、单细胞全转录扩增技术(wholetranscript amplifica 再到肠上皮化生,最终进展为 GC。在 GC 进展过程中 TME
[21]
tion for single cells,Quartzseq) 以及日本理化所开发的 细胞的变化尚未阐明,因此,scRNAseq 技术可以帮助检测
[22]
Quartzseq2 等方法的发展和运用,大大拓展了 scRNAseq 特定的细胞和转录特征,以揭示 TME 细胞与 GC 的关联。
[34]
分析技术的应用范围。目前,scRNAseq 分析逐渐成为研究 Yin 等 使用单细胞测序技术在 GC 发展过程中的各个阶
细胞间转录组的差异性,揭示细胞类型、亚型、状态和发展 段生成了各种 TME 细胞的动态转录组图谱,检测出一组与
[23]
轨迹等的有效方法 ,在揭示肿瘤发生发展、细胞异质性、 TME 细胞致癌相关的关键转变标记,如 PLAU、S100A8 和
微量样品的转录组分析、真核生物转录组基因复杂性等方 CLEC10A 基因,并描绘了这些细胞的动态致癌轨迹。因此,
面被广泛应用。 未来可以基于上述的关键转变基因确定免疫抑制检查点靶