文档介绍：生物信息学作业
一、Blast搜索
首先在NCBI的网页上打开Blast的网页,找到需要的数据库类型。
查询的序列直接粘贴到序列框中
可在该页面Algorithm parameters”栏目中更改相关的参数
2、点击BLAST以及Show results in a new window选择用新窗口展示分析结果
3、点击“Formatting options”,在新网页选择变换格式
如:将其改变为Pairwise with dots for identities”格式
4、通过选择几个需要比较的序列,然后点击Distance tree of results”显示检索到的序列之间的同源关系
5、结果显示为:
6、保存:选择需要的序列,按Download保存
二、在记事本中可得到结果
比对法
一:ClustalW比对法
1、进入页
2、在查找框中找到Find resources 以及ClustalW,得到页面
3、点击Clastw得
4、可在该页面上进行先关参数的设计,同时可在框中输入需要比对的序列,按下Run Clustalw可得比对结果
(由于网速问题只能进行到该阶段)
二、CLUSTAL X对比法
1、打开相应软件
将需要比对的序列从软件中导入
2、可对相关的参数进行设计:即按Alignment中Alignment Paramenter下的Multiple Alignment Paramenter即可进行
3、比对:plete Alignment即可得到比对结果
4、保存: