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高分辨率溶解曲线.ppt

上传人:卓小妹 2022/8/26 文件大小:4.32 MB

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高分辨率溶解曲线.ppt

文档介绍

文档介绍:高分辨率溶解曲线
第1页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
第2页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
内容提示
高分辨熔解曲线(High Resolution MeltinTm值范围: 70-88 ℃
优点:不需要探针,直接利用PCR产物针对已知突变位点进行基因分型
第16页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
第17页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
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第19页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
为何要使用温度内标
第20页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
A>T SNP without Calibration – 72bp
第21页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
Apply Temperature Calibration
第22页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
A>T SNP with Calibration
第23页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
Small Amplicon Genotyping
等对北京油鸡A-FABP基因进行小片段法基因分型,扩增片段为56bp,灰色曲线显示的是杂合型(CT),蓝颜色和红颜色曲线分别代表纯合型CC和TT。
第24页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
内容提示
高分辨熔解曲线(High Resolution Melting)的定义
高分辨熔解曲线在蚕的遗传育种中的应用
— 筛查突变 (mutation scanning)
— 基因分型(Mutation Genotyping)
—小片段+内标法( Small Amplicon Genotyping )
—非标记探针法(Unlabeled Probe Genotyping,LunaProbe)
—SSR分析
— 检测***化
HRM仪器
第25页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
HRM – Lunaprobe genotyping
第26页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
HRM – Lunaprobe genotyping
第27页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
1 Probe – 1 SNP, All Possible SNPs
第28页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
1 Probe – 1 SNP, All Possible SNPs
Class 1 C:T, G:A
Class 2 C:A, G:T
Class 3 C:G
Class 4 A:T
第29页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
1 Probe, 2 SNPs, 1 Amplicon
第30页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
2 Probes, 2 SNPs, 1 Amplicon- ApoE
第31页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
2 Probes, 2 SNPs, 2 Amplicons - HFE
第32页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
Amplicon Scanning – 发现新的突变
第33页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
David De ,Yong Song at og high-resolution DNA melting for genotyping and variant scanning of diploid and autotetraploid potato Mol Breeding (2010)
25:67–90
rr
RR
Rr
Mix Rr:rr by 1:1 Rrrr
Mix RR:Rr by 1:1 RRRr
第34页,共46页,2022年,5月20日,17点17分,星期四
内容提示
高分辨熔解曲线(High Resolution Melting)的定义
高分辨熔解曲线在蚕的遗传育种中的应用
— 筛查突变 (mutation scanning)
— 基因分型(Mutation Genotyping)
—小片段+内标法( Small Amp