微生物种群鉴定.ppt

文档介绍：微生物种群鉴定技术
微生物鉴定的目标
是什麽种属?
样本中有无目标微生物?
目标微生物定量;
种群比例;
微生物亚型;
菌群中各种微生物比例变化;
菌种改良
微生物鉴定的技术发展
形态和培养;
生理生化:营养、代谢、酶谱等;
免疫学:血清学、胶体金、ELISA;
细胞壁成份:脂肪酸等;
DNA杂交;
PCR、RFLP、RAPID、AFLP、PFGE等;
测序技术;
实时定量PCR技术;
芯片技术、质谱等
传统方法----1形态和培养
优点: 缺点:
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传统方法----2 生理生化
营养:碳源、氮源利用;糖酵解、淀粉水解、明胶水解等
代谢:显色反应;V-P,***红、吲哚、H2S等;
酶:酶谱分析;
传统方法----2 生理生化----设备
传统方法----3 免疫学
传统方法----4 细胞壁组份MIDI
传统方法的流程
取样
富集
单菌落
初分类
鉴定
相似性分析
选择鉴
定板
传统方法的缺陷
流程相对复杂,耗时长,3天以上;
每次鉴定一个细菌;
必须是单菌落,不能直接做混合样本;
相似性分析,鉴定不够准确,无法到种、亚种;
成本高,尤其是做种群;
无定量,无法做种群比例变化;
可鉴定钟内少,约3000种;