文档介绍：肿瘤相关基因:非编码RNA
庄诗美
2012-10-21
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对多细胞生物基因组的新认识
人类基因组的成分:
全长
(bp)
3 X 109
蛋白编码区
(%)
非编码区
(%)
蛋白编码基因
(个)
~25,000
人与线虫的蛋白编码基因数目差别不大
线虫
~20,000
人类
~ 25,000
2
对多细胞生物转录组的新认识
~70%的基因组被转录成了RNA
~2%的基因组编码蛋白质
miR
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Adapted from German Cancer
Research Center official
website
对多细胞生物基因组的新认识
基因组非编码区
转录形成非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)
Junk DNA ——
Hidden Treasures
形成庞大而复杂的RNA调控网络
在RNA水平对蛋白编码基因的调控
ncRNA: microRNA,lncRNA
选择性剪接(Splicing)
RNA编辑(Editi )
(Editing
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非编码RNA调控网络
•基因组结构
•转录
• mRNA可变剪接
•翻译
Human Molecular ics, 2005, Vol. 14,
5
成长19
microRNA :生成及其作用机制
在RNApol II的作用下转录出初级转录本(pri-miRNA);
pri-miRNA经drosha酶加工成长70nt左右的具“发夹”结构
的前体(pre-miR);
pre-miRNA被exportin 5 转运至胞浆,并被Dicer酶剪切形
长19-25nt t的双链RNA;
成熟体miRNA链与RNA沉默复合物(RISC)形成RISC-miRNA复
合物,通过特异的碱基配对方式结合到靶基因mRNA的3’UTR
导致翻译抑制或mRNA 降解,从而实现对蛋白编码基因表达
水平的调控。
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MicroRNA (miRNA, 微RNA)
非编码RNA家族
单链RNA,19~25 碱基
位于内含子/外显子/基因间
约占人类基因组~1%
对蛋白表达具有强大的调控作用
通过碱基配对结合mRNA的3’UTR
导致翻译抑制或mRNA降解。
一个miRNA可调控多个蛋白的表达
一个蛋白受多个miRNA的调控。
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miRNA发挥作用的新机制
hnrnp E2结合到C/EBPα mRNA上,抑制C/EBPα的翻译
mir328可以竞争结合hnRNAp E2, 从而促进C/EBPα的表达
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第一个被发现的miRNA---lin-4
1993年
Victor R. Ambros
Lin-4的二级结构 9
线虫 C. elegans
Gary Ruvkun
MicroRNA的命名规则
,保留原来的名字,
如cel-lin-4,hsa-let-7。
:
数字代表被发现
的顺序,每一个新
发现的miRNA都会获
得一个新号码
hsa-miR-122
物种名称简写
如:人 has,小鼠 mmu,线虫 cel
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