文档介绍:物理化学学报(WuliHuaxueXuebao)
February ActaPhys. ., 2008,24(2):301-306 301
[Article].cn
HMG鄄CoA 还原酶抑制剂三维药效团的构建
鲍红娟张燕玲乔延江鄢
(北京中医药大学中药学院, 北京 100102)
摘要:以作用于鼠肝脏细胞的 21 个 3鄄羟基鄄3鄄甲基戊二酰辅酶 A(HMG鄄CoA)还原酶抑制剂(RI)为训练集, 训练
-1
集化合物具备结构多样性, 来源于相同药理模型, 活性值 IC50 范围在 -8000nmol·L . 利用Catalyst 计算
HMG鄄CoA 还原酶抑制剂最优药效团由一个氢键受体, 一个氢键给体, 一个疏水基团和一个芳香环特征组成. 药
效团模型 Fixedcost 值,Totalcost 值和 Configurationcost 值分别为 、 和 . 训练集化合物活性计
算值与实测值相关系数为 , 偏差值为 , 交叉验证结果表明, 药效团模型具有较高的置信度, 对测试集
化合物活性值的预测结果显示有较好的预测能力, 可用于数据库搜索发现新的具有该活性的化合物, 也可用于
中药或天然产物药物的研究开发.
关键词: HMG鄄CoA 还原酶抑制剂; 三维药效团; 数据库搜索
中图分类号: O641
PharmacophoreModelGenerationofHMG鄄CoAReductaseInhibitors
BAOHong鄄Juan ZHANGYan鄄Ling QIAOYan鄄Jiang鄢
(SchoolofChinesePharmacy,BeijingUniversityofChineseMedicine,Beijing 100102,)
Abstract: Athree鄄dimensionalpharmacophoremodelof3鄄hydro鄄3鄄methylglutarylcoenzymeA(HMG鄄CoA)
reductaseinhibitors(RI)
sethadgreatdiversityinbothmolecularstructureandbioactivityasrequiredbyHypoGenprogramintheCatalyst
-1
-8000nmol·L .
Thebeststatisticalhypothesis,consistingoffourfeatures,eptor,onehydrogen鄄bonddonor,one
ringaromaticfeature,andonehydrophobicpoint,,aroot