文档介绍：主讲人:谭燕平
万谦
陈明
ChemSketch软件应用
ChemSketch简介
ACD/ChemSketch 是高级化学发展有限公司(ACD)开发的用于化学结构式绘制软件包,该软件包可单独使用或与其他软件共同使用。该软件的主要功能包括:
结构模式:用于化学结构式的绘制
绘图模式:用于图片及文字的处理
分子性质模式:用于计算分子的一些基本性质,主要包括以下几个方面:
分子量及元素百分比含量
折射率、摩尔折射率及摩尔体积
等张比容、表面张力及密度
介电常数及极化率
单一同位素质量, 标称分子量和平均分子质量
除了以上主要功能外,ChemSketch还包括3D Viewer,MR DB和HNMR DB可用于预测和查看所绘制化学结构式的碳、氢核磁谱图,并与所带相关数据库相联,进行检索比对处理。
ChemSketch内置的元素同期表可以查看元素的基本信息和核磁数据。有机分子结构字典只有商业版本才能使用,输入分子名称(系统命名或商品名)可得到其化学结构式。
化学文件夹(ChemFolder)可方便用户建立自己的试剂与化学反应数据库。GC和LC模拟器(GC Simulator and LC Simulator)可以模拟所绘制化学结构的气相和液相色谱。
LogD和LogP用于计算所绘制结构的醇—水(辛醇—水)分配系数,其中LogD适用于酸碱性物质,LogP适用于中性物质。
Name模块用来对所绘制的结构按IUPAC规则命名。
SolDB模块可用来计算所绘制结构在不同pH条件下的溶解度。
SpecManager用于处理各种谱图,包括核磁、质谱、紫外、红外等。
Spectrum DataBases提供了各种谱图的数据库,供检索查询之用。
XNMR提供了对含P、F、N同位素化合物的核磁预测功能。
pKa模块可对所绘制的结构进行酸碱解离常数的预测计算功能。
和其它的Windows软件一样,ChemSketch也具有页面设置、打印设置、输出模式、输入模式、页眉页脚设置等功能。
这里主要介绍如何利用该软件绘制化学结构式并对所绘制结构的基本化学性质进行预测和计算。
一绘制简单结构
1 使用常用画图
当程序开始时,常用画图工具是默认的。在这种模式下,您可以很容易地画直链和分支结构,并用元素周期表中的原子取代所画的原子。
单击CH4以增加一个CH3基团,并以标准键长连接。再双击同一个碳原子,画出
画图模式窗口与结构绘制窗口类似。
如果想让分子以某个键为基准改变位置,如让某一键处于垂直状态,可点击工具栏上的按钮,然后点击某一键,即可使分子旋转至该键处理垂直的位置:
单击最右边的碳原子,画出
重复以上步骤,画出一些结构
2 双键和三键
所画的结构式中的最后一个单键上再次单击获得双键;
再次在双键上单击获得三键:
如果您加了过多的原子, 可以逐一去除原子:
点击Delete 键
单击Undo 键。这会将ChemSketch的界面恢复到以前的设置
, 我们建议您养成及时保存文件的****惯。
4 聚合物
ChemSketch提供了聚合物结构的绘制功能:
在结构工具栏上点击Polymers 键,出现聚合物面板后就可以进行如下设置的更改了:
通过点击或拖拽来选定产生聚合物的区域。当区域被选择, 聚合物出现在工作区:
再次点击Polymers
键就可以离开聚合物绘制模式
5 改变原子
单击原子工具条下的元素周期表(Periodic Table)键,打开元素周期表(Periodic Table of Elements):