文档介绍：复旦大学
博士学位论文
复杂性状家庭聚集性统计分析方法的研究
姓名:郜艳晖
申请学位级别:博士
专业:流行病与卫生统计学
指导教师:姜庆五
20040428
复杂性状家庭聚集性统计分析方法的研究摘要复杂性状的家庭聚集性分析是遗传流行病学研究的第一步,是随后的分离分析确定遗传模式以及连锁分析定位致病基因的基础。判断疾病表型是否存在家庭聚集性,了解家庭聚集的模式以及识别家庭聚集的因素来源可以为随后的病因研究提供重要的方向和线索,但目前关于家系资料或病例对照家系资料的统计分析研究主要内容包括家庭相关的测量和遗传方差分量模型两部分。拟合多变量均数和相关系数的边际回归模型,通过构建不同的关联结构设计矩法可以得到回归系数和关联参数的稳健估计。以錾砀吆诵募蚁底柿衔@回归模型框架下,联合条件模型和边际模型的方法。同时建立先证者表型的均数、修改关联结构设计矩阵,便于检验各种家庭相关模式的假设;该法可用于任意家系资料结构;以及可利用现有标准软件轻松实现等优点,非常方便流行病方法仍需要进’步研究。本课题主要研究不同性状表型饕0ㄊ啃宰矗量性状和删失性状彝ゾ奂苑治龇椒ǎ荚谖A餍胁⊙д咛峁┮幌盗惺涤谩有效、方便的疾病家庭聚集性的统讨分析工具。彝ハ喙氐牟饬糠椒喙叵凳捎糜诓饬渴啃宰吹募彝ハ喙亍6约蚁党稍钡氖勘硇停车,可灵活检验各种家庭相关模式的假设。使用二阶广义估计方程的方探讨了方法的实际应用。对二分类性状,我们提出一种病例对照家系资料的分析方法。在先证者表型条件下亲属表型均数的边际模型,和亲属表型关联的边际模型。条件关。边际相关系数模型参数估计方法同数量性状;边际模型用替代回归惴ń胁问兰啤B殉舶┖投┑牟±哉占蚁底柿戏治鱿允靖法在估计危险因素和疾病的关联方面,因充分利用信息而有较高效能;通过灵活学研究者的实际应用。同时肝癌的家庭相关分析显示,肝癌病例亲属的疾病风险是对照亲属的抖啵腋尾《感染列肝癌的家庭聚集性有很大的影响。失特性的生存时间。对病例对照家系设计资料,根据先证者发病年龄,建立亲属发病年龄的分层P停戎ふ吆颓资艏浞⒉∧炅涞亩允徊姹瓤勺魑;毓橄数的一部分通过最大偏似然估计得到。多亲属瓷料时,多元失效时间的边际模型和边际/相关系数分别用于测量先证者和亲属间、亲属间疾病表型的家庭相交叉比可用于估计生存时间资料的家庭相关。个体的发病年龄可看作具有删年复旦大学博士学位论文中文摘要
得到近似一致的参数估计。同时和基于似然的限制性最大似然估计法用于考虑亲属间的相关。上述方法运用于肝癌病例对照家系资料,显示母子间发病年龄家庭相关高于父子和同胞。糯ǚ讲罘至磕P在广义线性混合模型的框架下,构造数量性状和质量性状的遗传方差分量模型。假设遗传因素和环境因素共同作用于疾病表型。其中,可以测量的环境因素和遗传标记可看作固定效应,无法测量的遗传因素挚煞纸馕R糯加性效应和遗传显性效应屯蚕砘肪承в煸图彝ソ萄肪又称家庭共享环境效应煽醋魉婊вΑB矶煞蛄疵商乜薹糜诨归系数和随机效应方差分量参数的估计。数量性状时,模拟研究显示法可相比,方法在参数推断方面有更强的优越性,在小样本情况下可得到更稳健的参数估计。质量性状时,由于方差分量的多参数问题,在参数估计过程中使用一种循环估计方法。小样本情况下,采用数据膨胀方法。模拟研究显示法可得到近似的参数估计。将上述方法应用于肝癌的病例核心家系资料,结果显示较小的遗传加性效应和同胞共享环境效应。对删失性状,我们扩展了啻嗳跄P偷紺方差分量模型,并对方法用于该模型的参数估计发病年龄的遗传加性方差和同胞共享环境方差分量有统计学意义,且同胞共享环境方差分量较大,提示存在未知的遗传显性效应或同胞间共享环境凶素的作用。关键词:数量性状质量性状发病年龄进行了初步探索。将该法应用于肝癌的病例核心家系和扩展家系资料分析显示,家庭聚集性肝癌家庭相关方差分量病例对照家系研究年复旦大学博上学位论文中文摘要
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前言医学研究中,许多常见慢性疾病包括癌症、心血管病、变态反应性疾病、精神性疾病等的病因都是极其复杂的,遗传因素和环境因素可能共同作用于这些疾病。为识别这些复杂病因,遗传流行病学研究索常采用家系设计,以家庭为单位,素和疾病关联的信息,同时也隐含了疾病的家庭聚集性和疾病的遗传模式信息。病存在家庭聚集性并不完全表明疾病一定存在遗传病因。但是强的家庭聚集性的证据仍然是进一步研究疾病遗传机制的首要条件,特别是测量疾病家庭相关的大小、家庭相关的模式和识别家庭相关的因素来源可能为疾病的遗传机制研究提供回归模型,回归模型等赡艿贾挛O找蛩囟约膊”硇陀