文档介绍：上海第二医科大学
硕士学位论文
日本血吸虫基因组的全基因组鸟枪法测序的拼装
姓名:吕纲
申请学位级别:硕士
专业:遗传学
指导教师:陈竺
20050501
∥作者签名:垦姻学位论文作者签名;吕初对风;日期:。据我所知,除文中已经注明引用的内容外,本论文不包含其他个人已经发表或撰写过的研究成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体,均已在文中作了明确说明并表示谢意。本人完全了解上海第二医科大学有关保留、使用学位论文的规定,学校有权保留学位论文并向国家主管部门或其指定机构送交论文的电子版和纸质版。有权将学位论文用于非赢利目的的少量复制并允许论文进入学校图书馆被查阅。有权将学位论文的内容编入有关数据库进行检索。有权将学位论文的标题和摘要汇编出版。保密的学位论文在解密后适用本规定。日期:导师签名
日本血吸虫基因组的全基因组鸟枪法测序的拼装中文搞要血吸虫病是一种严重危害人类健康的寄生虫病,为更好的从分子水平开展对其发病原理的研究和的疫苗及药物研制,国家人类基因组南方中心对血吸虫基因组采用了全基因组鸟枪法其中来自虰三类文库的兆条序列。经预处理后除%的序列位于分组大小超过条序列的分组中。最后的拼装结果包含了,跣蛄校计鹗夹蛄惺康%。的数目为艹ざ任,;笮∥,罨氖课:总长为,罨籒大小为碱基。血吸虫草图的获得给该病源体的基因发现、功能基因组学研究以及致病机理关键词:血吸虫血吸虫病日本血吸虫全基因组鸟枪法测序拼装软件寄生虫病测序和拼装,获得了倍覆盖率下的血吸虫基因组的草图。去载体、污染和低质量序列后,使用砑衅醋啊6杂,条通过预处理的序列,渲械,条序列分成了个组,的认知、疫苗和药物的研制奠定了基础。.第彻卜海第二医科人学懒畚
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前言部分刖舌鄙分一、血吸虫病血吸虫病是由于人或哺乳动物感染了血吸虫所引起的一种人畜共患寄生虫病。是全球范围内第二严重的寄生虫病。目前,血吸虫病流行于世界龉和地区。据世界卫生组织统计,血吸虫病流行于世界个国家饕N7⒄怪国家腥救薊亿,%的全球人口受威胁,是世界卫生组织重点控制的热带病之一。上海第二医科大学硕士论文第旯
日本血吸虫的生物学背景血吸虫病有急性、慢性之分。急性血吸虫病是在大量感染尾蚴的情况下发生的,病人发病迅猛,可在短期内发展成为晚期或直接进入衰竭状态,导致死慢性血吸虫病·般发展较慢,早期对体力有不同程度的影响,进入晚期后则腹水、巨脾、侏儒等症,患者劳动力丧失,甚至造成死亡。世界卜共有埃及血吸虫、曼氏』血吸虫、日本血吸虫、间插血吸虫、湄公血吸虫等旨纳谌颂宓难N嫜现匚:θ死嘟】怠H毡狙N娌∧壳爸饕A餍杏中国、菲律宾和印度尼两亚,其传播环节多、流行因素复杂,是所有人体血吸虫病中对健康危害最严重的血吸虫病。在我国流行的是日本血吸虫病,主要威胁着长江流域约多万人口。半个世纪来,我国血防工作获巨大成就。然而血吸虫尚未彻底消灭,近年来我国血吸虫疫区面积和发病人数有快速增长的趋势。∪匀谎现匚:ψ盼夜把侵抟咔群的健康和经济发展。海第医科人学坝卜论殳笫汗
掷嘌血吸虫为动物界扁形动物门吸虫纲中的一类,因为其成虫期寄生于脊椎动物血管中而得名日本血吸虫在动物界的位置:动物界扁形动物门吸虫纲复殖目裂体亚目裂体超科裂体科裂体亚科裂体属日本种上海第二医科大学硕十论文第彻
毡狙N娴纳钍血吸虫的生活史包括卵:、毛蚴.、:、童虫:,若粪便污染了水,虫卵被带进水中,在水里孵出毛蚴。毛蚴能在水中自由游动,并主动钻入水中的钉螺体内,发育成母胞蚴,进行无性繁殖,产生予胞蚴。子胞蚴再经一次繁殖,产生大量尾蚴,尾蚴离开钉螺在水中自由游动。人们因生产劳动、生活用水、游泳戏水等各种方式与含有尾蚴的水接触后,尾蚴便很快钻进人体皮肤,进入皮肤后即转变成童虫,经过一定时间的牛长发育,最终在肝、肠附近的血管内定居寄牛。并发育成熟,成为成虫。雌、雄成虫结伴合抱,交配产卵,每条雌虫每天可产卵二三千个。这样一个周期即是血吸虫的一生,即生活史。个阶段。
三、基因组学背景蜃榇笮蜃榈墓钩诵含量在血吸虫的生活史中,有两个宿主,⋯个是被成虫寄生的人和其它哺乳动物,其中,可感染并传播日本血吸虫的动物宿主有牛、猪、羊等动物。日本血吸虫是由日本学者于血吸虫基因组的大小约为獻,大约是线虫的三倍,果蝇的两倍以及人以清晰地确定其核型。血吸虫拥有匀旧澹匀旧逦獄汀<创瞥嬗涤美洲组。他们之间的区别可以从染色体的大小、形状潘苛5奈