文档介绍:用PCR扩增16SrRNA基因鉴定幽门螺杆菌的细
【摘要】目的: 探讨幽门螺杆菌及其稳定L型的检测与鉴定方法。方法: 用抗生素诱导、滤菌器过滤、非高渗透压培养基培养获得幽门螺杆菌稳定L型纯培养物,对幽门螺杆菌及其稳定L型进行16SrRNA基因的PCR扩增及序列测定。结果: 幽门螺杆菌及其稳定L型的16SrRNA基因PCR扩增产物经1%琼脂糖电泳,在紫外检测仪下可见550 bp的DNA条带,测序结果经NCBI Blast分析比对,基因同源性可达100%。结论: 16SrRNA基因PCR检测可用于幽门螺杆菌L型及其他形态变异的菌种鉴定。
【关键词】螺杆菌,幽门; 细胞壁; 稳定L型; 16SrRNA基因; 聚合酶链反应
[Abstract]Objective: To exploit effective methods for detection and identification of Helicobacter pylori and its stable cell (Lform). Methods: Stable Lform of H. pylori in nonhyperosmosic medium and purified by filtration. The 16SrRNA gene of Lform and normal H. pylori plified by PCR and analyzed ately 550 bp. and their sequences ology H. pylori could be identified through analyzing its 16SrDNA ; 16SrRNA; polymerase chain reaction
幽门螺杆菌(HP)是定植于人胃部的一种革兰阴性细菌,与慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌等疾病的发生密切相关[1]。HP容易发生圆球形变异,多数学者认为HP球形转化与HP感染的迁延不愈、反复发作及流行传播密切相关[2],细胞壁缺陷型HP属于圆球形变异中的一类。由于细胞壁缺陷导致细菌的原有形态、代谢活性、表面抗原、致病性等发生改变,以致采用常规细菌学方法难以分离和鉴定,从而导致病原学诊断的漏诊、误诊甚至延误治疗[3]。目前国内外文献均未见到关于HP稳定L型的鉴定方法,2007-2008年采用抗生素诱导、非高渗透压培养基培养法获得HP稳定L型,对其进行16SrRNA基因PCR检测与测序分析。
1 材料与方法
材料
菌株:HP菌株SS1、NCTC11637、NCTC11639,获赠于中国疾病预防控制中心传染病预防控制所。诱导剂:注射用头孢曲松钠(Ceftriaxone sodium),上海罗氏制药有限公司生产,批号SH0693。培养基:7%绵羊血哥伦比亚琼脂平板、PG液、布氏肉汤培养基按文献[3]及说明书方法制备。引物:参照文献[4]合成幽门螺杆菌种特异性16SrRNA基因的引物,上游引物为5′
CTTGCTAGAGTGCTGATTA 3′,下游引物5′ACACTCTAGAATAGT 3′,由北京天根生物工程有限公司合成,按说明书推荐方法使用。PCR扩增试剂盒和细菌基因组DNA抽提试剂盒,购自北京天根生物工程有限公司。
HP的培养
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