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生物信息学科研转化教学的方法与实践
邢军1,王兆月2,耿鑫1,张春燕2,田心2*
(1天津医科大学基础医学院,2天津医科大学生物医学工程学院,天津,300070)
【摘要】生物信息学是一门交叉学科,已经成为生命科学研究领域的重要工具,具有很强实践性和进展性。在教学中把前沿性的科研成果融入教学实践之中,充实教学内容,使科研转化教学并促进教学的进步。将丰富的科研资源转化为教学资源,发挥生物信息学的应用特性,形成培养学生能力的实践教学模式。
【关键词】生物信息学科研转化教学实践教学
生物信息学(bioinformatics)是生命研究领域的一门新兴学科,是现代生命科学与计算机科学、数学、统计学、物理学和化学等学科相互渗透而形成的交叉学科。它诞生于生命科学和计算机科学的快速发展的二十世纪,在分子生物学、国际互连网和生物医药的发展推动下,生物信息学以其快速发展的态势而倍受世人的瞩目【1】。
在生命领域中生物信息学已经成为科学研究的重要工具,国内外的相关研究硕果累累;作为新兴的学科,很多高等院校将生物信息学作为专业基础课程、专业课程设立。医学高等院校也逐步将其作为八年制、七年制、本科生基础课程或选修课设立。生物信息学是一门具有很强实践性和进展性的学科,将科研成果融入教学实践之中,及时补充更新教学内容,实现基础与前沿、传统与现代的衔接,使教学内容能够与现代科技进展同步,进而培养学生理论和应用相结合的能力。
生物信息学是一门涉及专业面宽泛的综合性学科,同时具有多元性、交叉性、实时性等特点。生物信息学具有强大包容性,容纳了现代生命科学,计算机科学、数学、统计学、物理学和化学等不同领域学科,由各学科之间的相互交叉而形成。同时生物信息学又具有广泛的应用性,如生命科学中的结构基因组学
,功能基因组学,比较基因组学,蛋白质组学,药物基因组学,代谢基因组学,肿瘤基因组
*通讯作者
学等。通过NCBI网站PubMed数据库进行文献检索可以得到大量的生物信息学相关文献见表1,生物学数据库的数量在九年间增长了近十倍,见表2和图1。大量的科学文献为科研教学提供了极其丰富的研究方法,快速增长的数据库为教学实践提供了种类繁多的数据资源。
生物信息学教师在进行科研工作的同时,亦应及时把自身的科研成果及方法融入理论教学和实践教学,不断充实教学内容,使科研转化教学、促进教学的进步,将丰富的科研资源转化为教学资源,形成适应学生能力培养的实践教学模式。
表1 生物信息学相关文献篇目
关键词
文献数目(篇)**
bioinformatics protein
39033
bioinformatics genomics
31854
bioinformatics gene
29846
bioinformatics proteomics
15267
bioinformatics cancer
8457
bioinformatics drug
7931
bioinformatics tools
5951
**NCBI PubMed数据库截止2009-12-29
图1 核酸研究(NAR)上收