文档介绍：NVIDIA GPU抑制登革热立大功
登革热所导致的断骨热,正如其名令人痛苦难耐,每年有数亿人受害,甚至有2万多人丧命,但科罗拉多大学(Colorado State University)研究团队利用NVIDIA Tesla图形处理器(GPU),可望打击这个无药可救的疾病。
据NVIDIA官方网站报导,科学家早就发现,登革热病毒之所以会存活,是因为非结构蛋白质3(NS3)不断复制的缘故,但至今仍无法找到「结合位点」下手,投药抑制NS3基因体复制。
先前科学家试图以超级计算机模拟NS3,但效果差强人意。为了找出NS3的结合位点,科学家必须虚拟模拟NS3的分子活动,但最佳时间尺度介于数十致数百奈秒,并不足以精确掌握NS3的复制流程,目前抑制NS3增生的药物不够有效,而且还会跟其它细胞蛋白质交互作用,进而产生副作用。
研究团队利用Tesla图形处理器,可以更有效模拟NS3的活动,尤其是高阶软件和快速运算把时间尺度从奈秒降为毫秒,研究团队进而发现NS3的氨基酸残基,一直在辅酶和核糖核酸(RNA)之间传递讯息,这可是科学家以往从没看过的景象。
研究团队表示
,会持续利用这个模型研究NS3的活动,毕竟兹卡病毒和西尼罗病毒也是靠NS3助长。科罗拉多大学助理教授MarTIn McCullagh表示, NVIDIA GPU和相应软件的发展,将有助于模拟NS3的活动情况,打击登革热、兹卡病毒等可怕的疾病。