置换检验在微阵列数据分析中的应用.doc

文档介绍：置换检验在微阵列数据分析中的应用作者简介:王婷(1984-),女,山西省永济市人,研究实习员,主要从事微阵列数据分析和贝叶斯统计研究,发表论文10余篇。电话:[phone]通迅作者:曾平,E-mail:******@,曾平(徐州医学院公共卫生学院,徐州221002)摘要:目的研究基于置换检验的微阵列数据多重假设检验和错误发现率的估计。方法采用置换检验获得统计量和p值,采用插入估计方法和微阵列显著性分析方法估计错误发现率,采用bootstrap抽样估计零假设的比例,Hedenfalk的乳腺癌微阵列被用来展示本文的方法。结果如选择作为拒绝域,;微阵列显著性分析方法中△=,。结论置换检验适合于微阵列数据,能够用来进行错误发现率控制和估计。关键词:微阵列数据;多重假设检验;错误发现率;置换检验;乳腺癌中图分类号::AApplicationofPermutationTestinMicroarrayDataAnalysisWANGTing,ZENGPing*(SchoolofPublicHealth,Xuzhoumedicalcollege,Xuzhou221002,China)Abstract:ObjectiveToinvestigatethemultiplehypothesestestinginmicroarraydatabasedonpermutationtestandestimatethefalsediscoveryrate(FDR).MethodsTheoriginalstatisticsandpvalueswereobtainedviapermutationtest,thenFDRwasestimatedusingplug-inmethodandsignificanceanalysisofmicroarrays(SAM),bootstrapsamplingwasappliedtoestimatetheproportionofnullhypotheses,Hedenfalk′-,△:Microarraydata;Multiplehypothesestesting;Falsediscoveryrate;Permutationtest;Breastcancer大数微阵列试验一个重要和共同的科学问题是识别差异表达基因以供进一步研究,例如,哪些基因在正常组织