文档介绍：天津大学
硕士学位论文
亲和性肽配基理性设计的可行性研究
姓名:刘夫锋
申请学位级别:硕士
专业:生物化工
指导教师:董晓燕
20050801
中文摘要关键词:硇陨杓疲呐浠珼缀蜕果分析发现,与稻哂泻芎玫南喙匦裕簿褪撬礑灾档大小可以反映配基与目标蛋白的结合力大小。将对接成功的多肽配基与目标蛋白质做分子表面发现,在多肽配基与目标蛋白之间的亲和作用中,静电相互作用明了是表征配基与目标蛋白亲和性的有效表达方式。然后利用氨基酸定位法、分子对接法和分子表面分析法,理性设计了与因此,认为利用计算机模拟来理性设计目标蛋白质的亲和肽配基是一种方本文验证了利用计算机分子模拟软件硇陨杓朴肽勘甑鞍字示哂懈亲和性多肽配基的可行性,。首先以从噬菌体展示七肽库中筛选得到的对坏矸勖浮⑷芫负鸵鹊核赜特异性结合的七肽配基谏锾匝≈杏胁煌珽值的多个肽段;。用药物分子模拟手段寻找了与多肽配基亲和性相对应的打分函数。通过结括氢键头兜禄RΦ墓毕捉洗螅杷嗷プ饔玫墓毕兹床淮蟆U饨徊街具有高亲和性的四肽配基。通过分子表面发现静电相互作用ㄇ键头兜禄Rκ撬碾挠雝岷锨坏闹饕W饔昧Α便、快捷、有效的方法。
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瓠莺签字日期:础年罗月多学位论文作者签名:多寸天肇学位论文作者签名:支蛩莭鹿蝗学位论文版权使用授权书独创性声明签字日期:知嗲年或撰写过的研究成果,也不包含为获得丞洼太堂或其他教育机构的学位或证本学位论文作者完全了解丞洼太堂有关保留、使用学位论文的规定。特授权丞洼太堂可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检町年亨月订书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中索,并采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编以供查阅和借阅。同意学校本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作和取得的研究成果,除了文中特别加以标注和致谢之处外,论文中不包含其他人已经发表作了明确的说明并表示了谢意。向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘。C艿难宦畚脑诮饷芎笫视帽臼谌ㄋ得导师签名:签字日期:
技术和刈榧际跷V鳎腹こ獭⒒蚬こ獭⒎⒔凸こ獭⑾赴こ毯偷鞍~身的新兴学科,成为当前世界各国高新技术发展的主要领域。随着现代生物技术的快速发展,天然存在的极微量的有用生物物质得以通过细胞⑸铩⒅参铩动物细胞嘌写蠊婺I5锕こ滩返姆掷氪炕屑细竦牟街瑁特别是对于药物蛋白必须具有完全的生物活性,并要满足医疗应用的特殊要求。溶剂、某些无机载体和金属离子很敏感,因此欲高效分离纯化存在于混有大量理化性质相仿的其它生物活性物质的大量组织匀桨或发酵液中的极少量目标产物,仅根据理化性质不同设计分离纯化工艺已远不能满足生物技术发展的需要【俊T此背景下,一种高效的分离技术——亲和层析技术孕育而生。亲和层析技术的最大优点在于,粗提液经过一次简单的处理便得到所需的高纯度的活性物质【俊8技术不但能用来分离一些在生物材料中含量极微的物质,而且可以分离那些性质和层析技术在目前分离纯化药物蛋白等生物大分子的应用中具有重要地位。色谱是利用一种称为流动相的液体流过介质一固定相,使混合物各组分发生不同程度的迁移,达到分离混合物的目的畸G缀蜕资俏缴椎淖钚路⒄埂它包含了一整套复杂的底物及其它配位体与生物大分子特异结合过程中所涉及的范德华力、静电力、氢健相互作用和疏水作用力。亲和色谱利用配位体和大分子之间的特异识别作用——亲和作用,使目标产物得以分离纯化的液相层析法。亲和色谱是利用生物大分子之间的特异性而不是物理、化学性质,这表明它非常适用于分离低浓度的生物大分子,如蛋白质,质粒等。正是因为利用的是生物学特异性而不是依赖于物理化学性质,因而非常适合于分离低浓度的生物产品。当欲分离的料液通过层析柱时,样品中对配基有亲和力的物质便借助静电作用、疏水作用、金属配位作用、氢键作用和弱共价键作用,以及结构互补效应等作用吸附到固相载体上。这些特点决定了亲和层析的高选择性和高纯化效率,也使它成为了分离生物大分子的最有效的手段哺刖吾生物技术将是世纪发展最为迅猛的关键技术之一。上个世纪以细胞融合质工程在内的生物技术的发展,己迅速地成为一门集现代生物科学和工程科学于由于生物大分子自身的特殊性和复杂性,如热稳定性差,对环境的值、有机十分相似的生化物质。人类已经利用亲和层析技术成功地分离了单克隆抗体、人生长因子【、细胞分裂素、激素、血液凝固因子、纤维蛋白溶酶等产品。可见亲前言
.旦止旦二厶芒亲和层析技术缀筒阄鲈第一章文献综述亲和层析是利用亲和吸附作用分离纯化生物物质的液相色谱法。亲和色谱的固定相是键合有亲和配基的亲和吸附介质。目标产物基于生物亲和作用吸附在固定相上而被分离,具有高度的选择性。亲和层析的基本过程明确