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亚型人禽流感病毒全基因组分析及其生物特性研究·论著·垦匿煎鱼瘗堂篮銎瘟堂苤查垫笙眢眦唧塑堑堕』垦匹荇蟊堕蟮簓丝:箜:腍琘麓叩姗癮流感病毒不出现人感染亚型禽流感病例,并导致多人死亡。虽然人感染禽流感病例都是流行病学上没有直接关系的散发病例,尚未构成流行,但是感染后重症和死亡率高,给人类健康和家禽养殖业带来台,从分子基因水平上探讨禽流感病毒的基特性,对该毒株的深入研究、防控策略制定和临床指导用药提供参考。沃恩康王怡婷陈帅帅吴海波尤金彪王巧刚郭潮潭目的分析研究切腿饲萘鞲胁《净蜃樾蛄刑卣鳎魅犯貌《镜姆肿咏吧镅特性。方法虶中获取蜃槿蛄校愿鞫位蛴胍阎P蛄薪蟹治霰冉希嬷平化树,并全面分析和预测病毒株的基因组特征、传染性、致病性、药物敏感性等。结果町病毒的基因组完全属于禽源,和基因属于欧亚谱系,其余位蛴朐睳切筒《就葱愿叽ァ8貌《旧胁感。结论该病毒是切汀切秃虷切颓萘鞲胁《救叩闹嘏涮澹杈韪枚局甑慕徊奖湟臁【关键词】禽流感;亚型;基因组;分子特性舮近十多年来,原为动物源性的、、、、和新甲型断攻击人类。今年略谖夜と堑厍蚴状严重威胁。目前关于该病毒的各种研究才刚刚开始,一系列问题都亟待解决。本文利用自主创建的流感病毒基因组信息库以及生物学特性快速分析平因组特征、传染性、致病性、药物敏感性等多方面的材料与方法一、流感病毒基因组序列获取虶中获取本次亚型人禽流【摘要】能在人与人之间有效传播,不呈现典型高致病性病毒特征,病毒对金刚烷胺和金刚乙胺耐药,而对奥司他韦敏鎙譵艘舰珿成咖醇埘琙,凰嘲【】.【玩昭,,:..鎓基金项目:国家自然科学基金资助项目晃郎靠蒲а芯炕鹱手钅Ⅵ—徽憬科技计划项目;浙江省卫生高层次创新人才培养工程项目作者单位:杭州,浙江省医学科学院生物工程研究所通信作者:郭潮潭,,.,:甌琲,甊瓹瑃%.’;
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基明嚣器,孺霍基因与我国的亚型病毒遗传关系接近,流感病毒的传播主要取决于蛋白的受体结合特异性,位于蛋白头部的受体结合位区主要#琀鞲胁《镜位螺旋一的能力,进一步分析发现病毒蛋白的通过自创的流感病毒基因组信息库以及生物学特性快速分析平台和美国国立生物技术信息中心在因序列与数据库中其他序列作最大同源性比较。进一步采用、.、等生物学软件分析毒株的序列特征和分子进化,并绘制遗传变异最为迅速的血凝素和神经氨酸酶基因的进化树。同时,从核苷酸序列和氨基酸序列两个层面进行系统分析,对病毒的基因特征、致病性、传播性、耐药性等方面进行综合分析评价。一、基因组序列分析结果毒序列,各地分离株的核苷酸序列同源性达%以表进一步分析其基因组全序列,确认该毒株属于征。各基因的片段大小以及与其核苷酸序列同源性最高的毒株见表6员敬蜨《就葱员冉谱系、,其余龌蛴際切筒《靖叨分离株属于两个距离较近的分支,但与北美地区的是东北亚的《镜耐葱愿撸氡泵赖厍分支,见图砻鱄《驹谝糯ń叵瞪系域性明显,和都可主要分为欧亚和北美两个谱系。此外,特别值得注意的是其蛋白~位氨基酸出现缺失,这在亚型中首次出现,此类缺失在其他亚型病毒中也极为罕见。其余毒的同源性都高达%,提示这位蛲耆ɡ醋于病毒,我们推测该毒株是亚型、亚型和亚型病毒三者的重配体,可能是候鸟迁徙过程中在我国长三角地区发生重配。这类毒株以前未见报道,是一种新型的禽流感病毒。二、人际之间的有效传播性由宦菪位环和换个结构域组外,