文档介绍：厦门大学
硕士学位论文
蛋白结构模拟预测H5型禽流感病毒保守中和表位及其抗病毒多
肽的初步设计
姓名:颜渊清
申请学位级别:硕士
专业:细胞生物学
指导教师:张军
20070701
篍緀趼源:D:,氨基酸萘鞲胁《崃春愣ㄇ,细胞毒性馨拖赴间接免疫荧光检测:窬彼崦:,核壳蛋白7哦谅肟蚣崃纯杀淝矩:,琼脂免疫扩散试验禽流感,抗原决定簇:重链恒定区:,道尔顿酶联免疫吸附测定,血凝抑制实验У蓝嗫乖,核定位信号:墙峁沟鞍篛芗量杉盎砻婊篧,世界卫生组织亓纯杀淝《綬篊篠缩略词篈:篊篒:篘:
声明人瑁貉眨讳鼋具厦门大学学位论文原创性声明兹呈交的学位论文,是本人在导师指导下独立完成的研究成果。本人在论文写作中参考的其他个人或集体的研究成果,均在文中以明确方式标明。本人依法享有和承担由此论文产生的权利和责任。
别磴氢议‘、醐:\/本人完全了解厦门大学有关保留、使用学位论文的规定。厦门大学有权保留并向国家主管部门或其指定机构送交论文的纸质版和电子版,有权将学位论文用于非赢利目的的少量复制并允许论文进入学校图书馆被查阅,有权将学位论文的内容编入有关数据库进行检索,有权将学位论文的标题和摘要汇编出版。保密的学位论文在解密后适用本规定。本学位论文属于朐谝陨舷嘤ê拍诖颉啊獭,
,,,耐;鞍椎砦灰彩怯个不连续的氨基分子与鯤肿拥亩越咏峁糜谘罢腋玫タ故侗鸬腍乖砦唬糜谘罢综合分析分子对接的结果表明:鞍椎腇砦皇怯个不连;鞍椎表位位于到之间的区域:,欧洲和非洲广泛地传播,不仅造成了巨大的经济损失,而且这种病毒已经感染到人类,导致人员的大量伤亡。随着病毒在禽类的连续性爆发,通过基因重配或者基因突变,这种病毒有可能在人与人间传播。据预测,如果病毒成为下一次全球性爆发的病毒株,由于人没有或者几乎没有对这种病毒株的免疫性,将会有上亿人死于这种病毒。粲跞蚋鞲国家都要有应对这种病毒的策略。最近本实验室鉴定出甓远嘀掷丛吹腍代表株均有良好中和活性的识别亚型血凝素的广谱单克隆抗体杂谘罢铱朔萘鞲懈弑湫缘墓闫字瘟菩钥固濉⒁呙绾鸵┪锞哂本研究应用分子模拟技术,将克隆得到的旯闫椎タ共捎谩暗浞督峁挂环法进行结构模建,模型结构在力场下进行能量最小化和分子动力学模拟的优化,并通过能量、“拉曼强传图煅椤治龅壤砺垩橹ぃ竦媒衔合理的昕固錐的三维空间结构。将甑タ笷分子依次与已有晶体结构的鯤切虷肿号是、和蟹肿佣越樱梅肿佣越咏峁治鯤切颓萘鞲的广谱中和表位和针对中和表位的药物设计的多肽参考物,其中综合单个与抗原良好契合的多肽结构。续氨基酸残基组成的:詌被岜嗪偶珹,”,重要价值。酸残基所组成:,,,珹琓
:,:..。所有这些结果将为亚型禽流感病毒广谱疫苗和治疗性药物的分子设计提供依据,为禽流感感染和中和机制以及受体研究提供有用的参考信息。关键词:禽流感病毒,结构预测,血凝素蛋白,多肽设计,
,琇琹,,,,妒.,:,”,.甌:.,:,瓼..眒琣瓵,瑃,摘要甇,—瑆.:
耐甈琒,,,..產,.舷盿气..篴摘要琣瑂
前言萘鞲胁《靖攀病毒引起的禽流感已经使全球各个地方都充满着恐慌。普遍情况下,只感染家禽,主要是鸡和鸭。然而,年在香港首次发现了菌株感染人类。从第一例感染人开始到年路荩琖已经报道了例人感染的例子,其中有怂烙谡庵植《尽K孀臜《驹谇堇嗟牧爆发,通过基因重配或者基因突变,这种病毒有可能在人与人间传播。如果病毒成为下一次全球性爆发的病毒株,由于人没有或者几乎没有对这种病毒株的免疫性,将会有亿到亿人死于这种病毒【流感病毒已经被认为是危及公共健康安全,并且有在人群中大规模爆发的潜在病毒。对于流感病毒的防治势在必行。蛋白质结构模拟技术为蛋白质的研究提供了一种新的手段,为解决蛋白结构和功能以及蛋白质工程实施方面所面临的难题提供了另外的一种可选方法,实现了生物技术与计算机技术的有效结合。抗体结构模拟技术是蛋白结构模拟技术之二,通过已知的抗体序列,可以模拟这个抗体的空间模型,从而为研究抗原抗体相互作用性质提供了依据。这种方法已经广泛应用于提高抗体亲和力,抗体的人源化及其抗原表位的分析。.禽流感病毒的形态特征及其化学组成粽巢《究鞲胁《臼簦珹型流感病毒。具有多型性,典型的粒子为球形,,长短不一,有的可达数微米。,病毒囊膜内有螺旋形核衣壳。囊膜由纤突,双层类脂膜和基质蛋白构成,纤突是在囊膜表面呈放射状排列的突起,长度