文档介绍：学校代码: 1 0 2 6 4
研究生学号 M090101042
:
上海海洋大学
硕士学位论文
三角帆蚌微卫星开发及在不同年龄与性别
题目:
群体遗传结构分析
Isolation of microsatellite markers and
Population ic Structure Analysis
英文题目:
between Sexes and Ages in Hyriopsis
cumingii
专业: 水产养殖
研究方向: 水产动物种质资源与遗传育种
姓名: 罗明
指导教师: 李家乐李应森白志毅
二 O 一二年五月
上海海洋大学硕士学位论文
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答辩地点答辩日期
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学位论文作者签名: 指导教师签名:
日期: 年月日日期: 年月日
上海海洋大学硕士学位论文
三角帆蚌微卫星开发及在不同年龄与性别群体遗传结构分析
摘要
三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)是我国主要的淡水育珠蚌,在我国五大淡水湖泊
中资源丰富。但由于过度开发、环境污染等原因,三角帆蚌资源显著减少,保护
天然种质资源是开展三角帆蚌育种的基础。本研究采用磁珠富集法开发了三角帆
蚌 20 对多态性微卫星,选用多态性高的 10 对微卫星标记评价了鄱阳湖(PY)和太
湖(TH)中不同年龄群体、不同性别群体的遗传结构,分析了这些野生群体三角帆
蚌的遗传变化规律,并对新鲜组织与无水乙醇固定不同时间组织间 DNA 提取效果
及幼蚌活体取样生长效果进行了比较,以期为三角帆蚌种质资源保护、资源评估
及合理利用提供理论依据,主要内容如下。
采用磁珠富集法,以生物素标记的(CA)10 寡核苷酸为探针,构建了三角帆蚌
基因组微卫星富集文库。根据微卫星位点的侧翼序列设计引物,随机挑选扩增出
与预期大小相符的 32 对引物,引物荧光标记后对洞庭湖群体的 24 个三角帆蚌个
体分别进行 PCR 扩增,共筛选出 20 对多态性较好的引物。结果表明,20 个微卫
星位点的等位基因数为 5-20,有效等位基因数 -。观察杂合度和期望
杂合度分别为 - 和 -;PIC 值 -;其中 14 个位
点符合 Hardy-Weinberg 平衡(P>)。本研究筛选的 20 个微卫星标记可作为三
角帆蚌遗传多样性、种群遗传结构等研究的理想分子标记。
采集了鄱阳湖 3~8 龄 297 个和太湖 7~15 龄 217 个野生三角帆蚌,用 10 对具
有高度多态性微卫星引物,分别对上述不同年龄群体遗传多样性进行分析,结果
表明:不同年龄群体间平均期望杂合度和平均 Nei’s 基因多样性变化不大,说明鄱
I
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阳湖和太湖不同年龄群体间遗传多样性差异不明显。比较平均等位基因数、平均
期望杂合度和平均多态信息含量,发现鄱阳湖 7 龄群体及 8 龄群体平均等位基因
数和平均多态信息含量低于 3 龄至 6 龄群体,太湖 9 龄群体低于 10 龄群体、13 龄
群体低于 12 龄群体和 15 龄群体,而其平均期望杂合度却相对较大。不同年龄群
体内个体基因杂合度结果显示鄱阳湖 7 龄群体及 8 龄群体、太湖 9 龄群体及 13 龄
群体个体基因杂合度大的比例相对较高。根据重大环境变化情况划分