文档介绍：抗原设计原理
为产生有效的抗体,第一步是设计好的抗原,此抗原可以来源于整个蛋白质
的一部分:一个或几抗原决定簇区域的序列。
(1) 什么是抗原决定簇?
蛋白质表面部分可以使免疫系统产生抗体的区域叫抗原决定簇。一般抗原
决定簇是由 6-12 氨基酸或碳水基团组成,它可以是由连续序列(蛋白质
一级结构)组成或由不连续的蛋白质三维结构组成。

(2) 选择抗原决定簇
为选择好的抗原决定簇,应符合以下三点:
:大部分抗原决定簇是亲水性的;
:大部分抗体只与蛋白质表面部分结合;
:许多已知的抗原决定簇是在自由活动区域。
所以一般来说蛋白质的 N 端及 C 端是很好的抗原决定簇区域。
(3) 抗原性与免疫原性
单独的抗原决定簇是不能产生免疫反应,它只有抗原性但没有免疫原性,
为使它能具有免疫原性,它必须偶联在载体蛋白上。
(4) 抗原决定簇的预测
对每个氨基酸的表面可接触性(Surface Accessibility)、亲水性(Hydrophilicity)
和弹性(flexibility)进行计算可以大体推算出抗原决定簇区域,抗原决定簇
区域应综合以上三个特点。目前市面上有几个专业测定软件满足需要:如
MacVestor , Protean , GCG 等。
(5) 设计合成多肽
一旦抗原序列决定后,接下来就是设计所需合成的多肽了,设计时除了注
意其序列外,同时应考虑一些产生免疫机制问题,如:
;
C 端的,此多肽 C 端一定是自由