文档介绍:广西师范大学
硕士学位论文
中国西南地区旱稻种质资源遗传多样性的SSR分析
姓名:张瑛
申请学位级别:硕士
专业:生物化学与分子生物学
指导教师:唐绍清
20080501
我国西南地区旱稻种质资源遗传多样性的 SSR 分析
专业:生物化学与分子生物学研究方向:植物分子系统学
研究生:张瑛年级:2005 指导教师:唐绍清教授
摘要
旱稻是栽培稻中一种特殊的生态类型。它在我国的栽培历史悠久,资源丰富,集中分
布在少数民族较多的云南、广西、贵州和海南等省(自治区)。旱稻具有耐旱性强、需水
量少的特点,是推行节水农业、旱作农业的最佳旱粮作物之一。利用 SSR 分子标记,本文
主要开展了我国西南地区旱稻种质资源遗传多样性的研究,对旱稻种质的保护、利用、核
心种质的构建和遗传育种具有重要的理论意义和使用价值。主要研究结果如下:
。221 份旱稻种质被分成了籼粳两大
类,其中有 167 份属于粳稻,54 份属于籼稻。
50 对引物中筛选出了 28 对 SSR 引物,对 221 份旱稻和 15 份水稻种质进行 SSR
遗传多样性分析。在 221 份旱稻种质中共检测到 269 个等位基因,平均每对引物 个,
多态信息含量(PIC)变幅为 ~,平均 ;在 15 份水稻中共检测到 155 个等位基
因,平均 PIC 值为 。按谷壳苯酚反应分类结果分析,旱粳稻的平均等位基因数目()
大于旱籼稻(),旱籼稻的平均 PIC 值()高于旱粳稻(),差异显著。表明
我,且旱籼稻的遗传多样性比旱粳稻丰
富。
,221 份旱稻种质被分成了籼粳两大类,与谷壳苯酚
染色反应分类结果完全相同,但旱稻种质不能按地理类群聚类,主成份分析支持聚类分析
结果。表明在进行旱稻种质资源的保护时应打破地理区域的限制。
分析表明,我国旱稻种质资源的遗传多样性主要来自籼粳亚种内(%),
亚种间遗传变异只有 %,遗传变异极显著。本实验所选取的 28 个 SSR 位点在旱稻籼
粳亚种间分化均显著,表现出很强的籼粳特异性,可以作为籼粳分类标记。
SSR 分子标记数据,从 221 份旱稻种质中筛选出了 50 份核心种质,保留了初
始种质 %的等位基因,平均多态信息含量为 ,能够很好的代表初始种质资源的遗
传多样性情况,可以作为候选种质在构建中国旱稻核心种质资源库时加以利用。
关键词:旱稻;种质资源;遗传多样性;SSR;核心种质
I
Assessment of ic diversity in upland rice germplasm
from southwest China using SSR markers
Speciality: biochemistry and molecule biology Subject: molecule phylogenesis
Master Candidate:Zhang ying Grade:2005 Supervisor: Prof. Shaoqing Tang
Abstract
Upland rice is a special ecotype of cultivated cultivation of upland rice in China has
a long history and it is rich in natural resources, it distributes concentratedly in the four provinces
(autonomous regions) of Yunnan, Guangxi, Guizhou and Hainan which have relative more
minorities. Upland rice has the traits of strong drought resistance and less water demand, which
is one of the best drought-resistant crops for implementing water-saving agriculture and dry
farming. The ic diversity in upland rice germplasm was