1 / 9
文档名称:

生物信息学分析.docx

格式:docx   大小:52KB   页数:9页
下载后只包含 1 个 DOCX 格式的文档,没有任何的图纸或源代码,查看文件列表

如果您已付费下载过本站文档,您可以点这里二次下载

分享

预览

生物信息学分析.docx

上传人:gxngqvk 2020/8/27 文件大小:52 KB

下载得到文件列表

生物信息学分析.docx

文档介绍

文档介绍:4、生物信息学分析通过核苷酸序列数据库和基因序列同源性在线分析途径初步对Rv2029c基因进行分类整理。由于结核分枝杆菌耐利福平野生株与核苷酸序列数据库KEGGGENES中的结核分枝杆菌标准株H37Rv的匹配率为100%,以下对基因的分析按照结核分枝杆菌标准株H37Rv的数据库信息进行,即完全匹配的1020bp长度序列(本次提取基因中包含上下游引物等序列,较长,1346bp)。-磷酸果糖激酶 PfkB组织来源结核分枝杆菌耐利福平野生株功能参与醣酵解:将糖-1-P转化为糖-1,6-(标准株)(图3)1、FruK(果糖-1-磷酸激酶(FruK)和关联的果糖-6磷酸激酶(PfkB)),位点13-3142、1-PFK(己糖激酶,1-磷酸果糖激酶家族),位点14-3123、PRK10294(6-磷酸果糖激酶2),位点12-3134、PfkB(PfkB家族碳水化合物激酶),位点18-3085、PLN02341(PfkB型碳水化合物激酶家族蛋白),位点208-2946、PTZ0029(核糖激酶),位点205-,%,%,%。转角结构和螺旋结构构成了结核分枝杆菌PfkB蛋白二级结构的骨架。:蛋白长度339aa,预测跨膜蛋白数0。 PredictProtein分析表明PfkB蛋白氨基酸残基没有信号肽,由此推断此蛋白不包含信号肽,不是分泌型蛋白质。,,最小疏水指数为-。-pletegenome100%%%%Mycobacteriumtuberculosis18bgenome100%%pletegenome100%%%%Mycobacteriumtuberculosis49-plete100%%菌株序列覆盖率E值一致性genomeMycobacteriumtuberculosisH37Rv100%%BAA-pletegenome100%%pletegenome100%%pletegenome100%%(BCG)标准株DNA对比表4基因与BCG标准株DNA