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QPCR原理及应用样本.doc

上传人:非学无以广才 2020/10/29 文件大小:1.77 MB

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QPCR原理及应用样本.doc

文档介绍

文档介绍:QPCR原理及应用因为Real-timeqPCR众多优点,现在已经是生命科学领域一项常规技术。越来越多研究文章中包含RT-PCR试验,也基础上被real-timeqPCR所替换。因为real-timeaPCR输出数据不一样于常规PCR电泳检测,很多没有做过real-timeqPCR研究者常常感到高深莫测,不知从何入手;甚至部分做过次试验研究者也会对数据处理分析感到迷惑,不知所措。本文就从real-timeqPCR发展史说起,包含real-timeqPCR原理,试验设计,实际操作,数据分析,常见问题解答五个方面,手把手教你从各个方面了解real-timeqPCR,根本从菜鸟到高手!一、Real-timeqPCR发展史Real-timeqPCR就是在PCR扩增过程中,经过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。因为在PCR扩增指数时期,模板Ct值和该模板起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量依据。因为常规PCR缺点,real-timeqPCR因为其操作简便,灵敏度高,反复性好等优点发展很快速。现在已经包含到生命科学研究各个领域,比如基因差异表示分析,SNP检测,等位基因检测,药品开发,临床诊疗,转基因研究等。在Real-timeqPCR技术发展过程中,定量PCR仪发展起了至关关键作用。1995年,美国PE企业(已经并入Invitrogen企业)成功研制了Taqman技术,1996年推出了首台荧光定量PCR检测系统,经过检测每个循环荧光强度,经过Ct值进行数据分析。从而荧光定量PCR取得广泛应用。现在定量PCR仪有ABI7000、7300、7500,7700、7900HT、StepOnePlusTM、M、******@M系列;BIO-RADCFX96、iCycleriQ5@、MyiQ@、MJResearchChromo4TMOpticon系列;StratageneMxTM系列;RocheLightCycler@系列;EppendorfMasercycler@;CorbettRotor-M;CepheidSmartCycler@和BIOERLineGene系列。随中国生命科学快速发展,科研水平不停提升,发高水平文章已不再是新鲜事。和其同时,中国企业经过长久不懈努力,也有自主研发real-timePCR仪器生产比如西安天隆科技企业TL系列仪器。二、Real--timeqPCR原理实时PCR就是在PCR扩增过程中,经过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。通常来讲,定量PCR仪包含:实时荧光定量PCR仪关键由样品载台、基因扩增热循环组件、微量荧光检测光学系统、微电路控制系统、计算机及应用软件组成。其中基因扩增热循环组件工作原理和传统基因扩增仪大致相同,不一样厂家不一样型号产品分别采取空气加热、压缩机制冷、半导体加热制冷等工作方法。独特是这个微量荧光检测系统。有由荧光激发光学部件、微量荧光检测部件、光路、控制系统组成。常见荧光激发方法有两种:卤钨灯和LED;荧光检测元件常见两种方法:D摄像机,光单色元件有滤光片和光栅。在实时PCR扩增过程中,荧光信号被搜集,转化为成为扩增和熔解曲线。具体数据就是基线,荧光阈值和Ct值。-timeqPCR数学原理首先来看一个real-timeqPCR中关键参数Ct值(Ctvalue),阈值(threshold),和基线(baseline)。通常来讲,第3-15个循环荧光值就是基线,是因为测量偶然误差引发。阈值通常是基线标准偏差10倍。在实际操作中也能够手动调整,在指数期就能够。Ct值就是荧光值达成阈值时候PCR循环次数。所以是一个没有单位参数。那么为何说Ct值跟初始模板量成反比呢?我们来看PCR扩增方程:   从线性方程上看,斜率(slope)为-1/lg(1+E),所以E=10-1/slope-1。假如从标准曲线上得到斜率(-),就能够算出扩增效率()。通常来讲PCR扩增效率在90%-110%全部是能够用于数据分析。效率低于100%,是因为PCR反应中存在抑制原因;而高于100%可能部分污染、非特异性扩增或是引物二聚体造成。-timeqPCR种类依据real-timeqPCR化学发光原理能够分为2大类:一类为探针类,包含TaqMan@探针和分子信标,利用和靶序列特异杂交探针来指示扩增产物增加;一类为非探针类,其中包含如******@GreenI或特殊设计引物(如******@Primers)经过荧光染料来指示产物增加。@探针法Taqman@探针是最早用于定量方法。就在PCR扩增时加入一对引物同时加入一个特异性荧光探针,该探针为一寡核苷酸:5’端标识一个汇报荧光基团,3’端标识一个淬灭荧光基团。探针完整时,汇报基团发射荧光信号被淬灭基团吸收,

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