文档介绍:#流程大放送#转录组测序数据处理与分析
介绍
转录组测序得研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来得所有RNA得总与,包括mRNA与非编码RNA。相对于传统得芯片杂交平台,转录组测序无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种得整体转录活动进行检测,提供更精确得数字化信号,更高得检测通量以及更广泛得检测范围,就是目前深入研究转录组复杂性得强大工具。基于高通量测序平台得转录组测序技术能够全面获得物种特定组织或器官得转录本信息,从而进行基因表达水平研究、新转录本发现研究、转录本结构变异研究等。
该技术可用于以下研究
观察疾病发生过程中病灶部位内部得基因表达水平变化
在肿瘤研究中,使用RNA-seq技术可以预测潜在得融合基因
新lncRNA预测与已知lncRNA表达水平研究
新物种得转录组数据构建与功能研究
数据分析流程图
预期图例展示
示例图1 差异表达基因筛选
示例2 基因聚类分析heatmap图
示例3 差异基因互作网络图
示例4 lncRNA、基因与上游共有miRNA网络图