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东方田鼠线粒体基因组序列及Y染色体部分序列测定及分析.pdf

文档介绍

文档介绍:东华大学
硕士学位论文
东方田鼠线粒体基因组序列及Y染色体部分序列的测定及分析
姓名:姜宪环
申请学位级别:硕士
专业:生物化工
指导教师:肖君华
2012-01
④缝懋东方田鼠线粒体基嘲蒯及旧宀糠重嵘径ḿ八进化关系,并已测出田鼠属蚴觙“吲伞癱和闯古鴖,必的东方田鼠线粒体基因组序列及旧宀糠中蛄械牟舛ḿ胺东方田鼠蔯加良觬加裟龀菽俊⒉质罂啤⑻锸笱强啤⑻锸首次测得了东方田鼠长江亚种蔯加皊加厂如肠脚癿吡L寤析摘要属,主要分布在我国,以及和我国接壤的俄罗斯、朝鲜、蒙古等某些地区。世纪年代以来,东方田鼠在洞庭湖区暴发成灾,不仅对当地的农林业造成巨大的损失,在迁移时还经常引发钩端螺旋体、流行性出血热等病疫。同时,东方田鼠还是重要的实验动物资源,我国学者现已利用东方田鼠构建出抗血吸虫病、糖尿病和卵巢癌等多种模型。对东方田鼠的生态防控以及作为实验动物的资源利用,都需要对其种群遗传结构进行先行研究。线粒体蚘染色体序列是研究物种母系和父系遗传进化史的有效工具。田鼠属包含多个物种,进化速度非常快,是研究系统进化的好材料。近年来,研究者们根据蛄醒芯刻锸笙低蜃槿蛄小8赶狄糯ń峁菇鲈谌死嗳禾逡糯а芯恐斜广泛应用,而在其他哺乳动物中研究很少。
麟东方田鼠线粒体基因组序列及旧宀糠中蛄械牟舛ḿ胺治ǚ教锸蟪そ侵謒的个Ⅲ蛑校因组全序列和旧逍蛄校饕=峁缦拢ǚ教锸蟪そ侵窒吡L寤蜃槲K椿纷捶肿樱蛄凶艹为珿登录号为话擞肫渌棺刀镆致的个基因龅鞍字时嗦牖颉个基因、个基因个控制区。其基因组组成有很强的偏向性,全线粒体序列涣吹募罨俜趾课#篈%.%.,.%ǚ教锸蟪そ侵謒的个蛋白质编码基因最常用的起始密码子是、、、、、、、╞基因浯问茿和。蚇基因比较特殊,起始密码子分别是臀授妗珻珹,琋琋和萣基因的终止密码子圆煌暾腡作为终止密码子。可以折叠成标准的三叶草二级结构;蠥鼋鲇督构缺少罚庵謙峁乖谄渌龀堇喽镏幸埠艹<个终止序列区猯和一、中央保守区和保守序列区一。但与已报道的两个田鼠种一样均没有发现ǚ教锸蟪そ侵謒的锤粗破鹗记ざ任是籒和虻闹罩姑苈胱邮荰;另外,和ǚ教锸蟪そ侵謒控制区的结构包括三个部分:两和。
麟东方田鼠线粒体基因组序列及旧宀糠中蛄械牟舛ḿ胺治法系统进化树表明,东方田鼠与尬觙觚朋如析槌山忝,可以形成茎环结构,与施艏觭航砌靎万蔯加皊发现,其长茎以及相邻的序列十分保守。’一’。种啮齿类动物线粒体涣吹龅鞍妆嗦牖蛐列法和法系统进化树表明,东方田鼠属于田鼠属的亚洲谱系。田鼠属鲋跣蛄线粒体碽基因序列的状尾獾昧硕ǚ教锸蟪そ侵趾椭该侵諽染色体上的序列,比对这两个亚种的序列后发现鯯坏恪序列,这将为我国东方田鼠的母系和父系遗传结构研究打下坚实基础;此外,提出了一种新的获得旧逍蛄械牟呗浴关键词:东方田鼠,线粒体基因组,长片段低撤⑸ū冉群。本论文测出了东方田鼠线粒体基因组全序列和旧迳喜糠
麟东方田鼠线粒体基因组序列及旧宀糠中蛄械牟舛ḿ胺治
禖丁【“,加Ⅳ括蚴蕀噏纾瞗,“絚,切砌踨凰,,.出,诔癿甅,珻篟琈,琈.,,,,.,,,,,,,琋,眀琭,—珼.’甌,—
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麟东方田鼠线粒体基因组序列及旧宀糠中蛄械牟舛ḿ胺治第一章绪论研究背景瞔加,趃⑻锸笫施饕7植加谥泄ū薄⒒1焙突D瞎鍪∏琭“蚆厂如,印五日,船合称为东北亚种科鰁,,已“,因而将该东方田鼠點加痢<樱属啮齿目、仓鼠科鏴鼠亚科在我国,东方田鼠一般认为包含鲅侵謋】,即指名亚种于黑龙江、吉林和内蒙古东北部;新民亚种省和湖南省环洞庭湖区;=鼋嫌蔚鼠划分为鲅侵帧;莆募傅纫嗳衔8檬笥个亚种,但分别将已胁“纾琭以,船称为黑龙江亚种和辽宁亚种。马勇【将分布在吉林和内蒙古的琭“裙槲DJ咸锸啮錳刀村M跬⒄】等将分布于内蒙古北部和辽宁、由定名的东方田鼠视为蒙古亚种厂如,记办隹趍。位点和凡岬昙堑确矫娑季哂邢嗨菩裕⒖稍咏唬诹笥肫渌降氐氖目前,东方田鼠的研究主要集中在国内。潘漪清㈣、朝鲜和蒙古亦有分布【俊分布于内蒙古自治区和宁夏回族自治区;乌苏里江亚种胁“,分布纾琭∞“炜冢皊植加诹赡吉林西部和内蒙古通辽市;长江亚种,:诔Γ阿,分布于江苏省、安徽建溪、富屯溪流域。然而,学术界还有很多学者对其分类尚存疑问,谭邦杰】和陈安国】等将谢建云等【院隙赐ズ厍

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