文档介绍：江苏大学
硕士学位论文
豌豆蚜虫bHLH转录因子家族成员鉴定及其基因的电子克隆
姓名:党春望
申请学位级别:硕士
专业:生物化学与分子生物学
指导教师:王勇
20120606
摘要类转录调节因子家族,既往研究发现该家族在生物的各个生长发育调成了真核生物蛋白质中的一个大家族B家蜃蛹易。转录因子是根据其结构命名的,因为蛋白在一段近个氨基酸的片段内具有特征的序列模式,即一个螺旋一环一螺旋基序—.及其上游富含碱性氨基酸的序列。动物转录因子根据转录因子又根据其所作用的<妥陨斫峁固氐惚环殖个高阶豌豆蚜虫是最先用于实验室和基因组研究的蚜虫,也是一种重要无性与有性生殖以及对药物抵抗性等多方面的研究。年底豌豆蚜虫蛄薪辛诵拚壳岸酝愣寡脸鎎B家蜃拥难芯亢少。本研究是用生物信息学的方法对豌豆蚜虫转录因子家族成员进行探索,目的就是鉴定豌豆蚜虫中转录因子成员的数目,判断豌豆蚜虫转录因子成员分别属于什么家族,并初步弄清豌⑼ü嘈蛄斜榷苑⑾郑谕愣寡脸婊蜃橹写嬖鯾录因子编码区域,这一结果与其它昆虫中的数目相近。其中,在个豌豆蚜虫基序的编码区域中有内含子,,蚣易迨且控过程橹跋赴姆⒂⒃鲋场⒎只中起重要作用,它们构其调控基因表达的功能不同被分成个家族,而这个家族中的组的生物学模型昆虫,广泛用于细菌的内共生现象、极端表型可塑性、虫的全部庑蛞淹瓿桑⒃月份对型愣寡豆蚜虫中编码转录因子的基因结构。获得的主要结果如下:江苏大学硕士学位论文。
基序在基因组中存在两个为其编码的区域,其基因的号分⑼ü低撤⑸治隹芍#愣寡脸鯾B家蜃映稍的分组及其家族归属情况为:橛鯾B家蜃樱籅组有个转录因子;橛个转录因子;橛个转录因子,即籈组有鯾B家蜃樱籉组有鯾转录因子,即T谕愣寡脸婊蜃橹忻挥蟹⑾直嗦階、、、和家族蛋白的区⑼ü缱涌寺》椒ɑ嬷瞥隽鐾愣寡脸娴腷蚪峁梗其中有龌虻慕峁故峭暾模龌虻慕峁菇衔M暾渌个基因的结构是不完整的。其余鯾蚪峁剐枰=徊降姆析。但在个豌豆蚜虫氨基酸序列中都有完整的结构存该研究所获得的结果为今后开展豌豆蚜虫生长发育调控机理方面的研究积累了基础资料,也为进一步开展这些基因的表达谱分析打下了良好基础。同时该研究也为深入分析豌豆蚜虫蛋白的结构提供背景资料。关键词:豌豆蚜虫,基因组,,转录因子,系统发生分析,电子克隆别为和域。在。豌豆蚜虫转录因子家族成员鉴定及其基因的电子克隆。
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缩写与符号江苏大学硕士学位论文Ⅵ
第一章绪论大学硕士学位论文生物信息学简介。镄畔⒀е饕Q芯磕谌生物信息学就是对生物大分子的信息进行收集/储存与加工/分析的新兴学科,其研究的主要内容为:袢∪撕透髦稚锏耐暾蜃椤;蜃檠芯康氖滓D勘晔腔竦萌撕推渌种的整套遗传密码。生物信息学提供了自动而高速的拼接序列方法,即根据—模型利用鸟枪法进行测序,:再将大量的随机测序片段进行自动拼接。此方法为准确获取人和各种生物的完整基因组提供了技术基础。禄虻姆⑾帧D壳肮驶蜃檠芯康娜鹊阒槐闶欠⑾中禄颍信息学用于新基因的发现对新基因的研究具有极大的促进作用。利用生物信息学方法寻找新基因大致分为两种:第一种,通过计算机分析从蛄惺据库中拼接出完整的新基因编码区即电子克隆;第二种,通过计算机分析从基因组蛄兄蟹治鋈范ㄐ禄虮嗦肭唇ɑ蜃樯媳嗦肭敕潜嗦肭分开,再将这些序列与已知基因组数据库比较就可发现哪些是新基因了。虻ズ塑账岫嗵分析。单核苷酸多态性就是相同基因在不同个体中存在的单个碱基上的变异而引起的基因差异表现。基因单核苷酸多态性为生物学研究提供了一个重要的工具,其多用于高危群体的发现、疾病相关基因的鉴定、药物的没计和测试及生物学的基础研究等。蜃橹蟹潜嗦氲鞍字是虻慕峁褂牍δ苎芯俊R话闳衔#堑鞍字时嗦肭的生物学功能体现在对基因表达的时空调控上。对非蛋白编码区的生物学意义分析一般有两种途径:第一种,用己知功能的<蛄刑卣髟げ夥堑白质编码区可能含有的一种功能<げ馄淇赡艿纳镅Чδ懿进行实验验证;第二种,基于理论知识直接分析非蛋白编码区未知序列的特征,并从理论上预测其可能的生物学功能并进行实验验证。诨蜃樗窖芯可锝;蜃檎遄橹绞皆谘芯课镏盅莼分芯哂重要的作用,这是因为基因组是物种所有遗传信息的储存库,从根本上决定江苏
豌豆蚜虫转录因子家族成员鉴定及其基因的电子克隆着物种个体的发育和生理。结合相应的生理表现特征进行基因组整体的演化史研究是揭示真实演化史的最好方法。ɑ蜃榈谋冉涎芯俊I镄畔⒀Р唤隹啥圆煌锏牡ジ龌蚪斜冉涎究也可对完整基因组进行比较分析,且基因组之间的差异可使我们从遗传本质理解一些生物学问题。因此可以说全基因组的比较研究