MiSeq标准参数指标.doc

文档介绍：MiSeq标准参数指标
高通量基因测序系统美国illumina公司Miseq
技术参数
1•仪器功能：可开展快速经济高效的第一代测序应用，包括扩增产物 测序和克隆检查等；也可以开展新一代基因组测序应用，如高度多重PCR 扩增子测序，小基因组重测序，de novo测序，小RNA测序，文库质控和 16s细菌宏基因组研究等；

*-轮测序反应生成的有效数据量最高可达15Gb （即150亿个碱 基）；* 一轮测序反应生成的可读测序片段序列最高可达2500万条;
* 一轮测序反应（最高完成15Gb数据量）的所用的全部试剂和耗 材成本不高于2000美元；一轮测序反应的过程包括样本文库克隆扩增、 测序和数据分析；* ; 双端读取序列的有效数据读长可达2 X 300个碱基。
（%）,并且75% 以上的碱基比例达到Q30；
；
<；
，可在一轮实验中同时检测384个样品，
对384X1536 = 589824个SNP的DN***段进行测序比对分析；
（如AAAAAAAAAAAAAAAA ）；
，并具有公共交流平台，方便与业内专家共同分 析与合作。
，主机同时具备样本文库克隆扩增、测 序和数据分析功能；无需再配置额外的样本文库克隆扩增和分析服务器;
：全基因组重测序、 定向重测序、De novo测序、序列特异DNA结合蛋白的ChlP-Seq、组蛋白 修饰和表观遗传标记的ChlP-Seq、16s宏基因组学研究、mRNA测序、基于 标签的基因表达、小RNA测序、降解DNA样品的测序、末端配对mRNA 测序、DNA印迹和等位基因特异