文档介绍：獾墓菇ḿ岸玖ο喙匾蜃拥纳覆摘要鳗弧菌基因组鳗弧菌是一种对鱼类危害严重的细菌病原,常给水产养殖业造成巨大的经济损失。由于鳗弧菌的基因组信息尚未阐明,限制了许多研究工作的深入开展。本研究构建了鳗弧菌的基因组文库,对文库的部分克隆二进行了末端测序;根据序列的生物信息学分析,对可能的毒力相关因子进行了预测;在此基础上从文库克隆和鉴定了一个营养必须基鸵桓龅鞍酌富Ⅶ┗【鶩蜃槲目獾墓菇ê图本研究构建了鳗弧菌的基因组文库,该文库包含隹寺。迦肫断平均长度为。⒘烁梦目獾某冻睾投冻兀用于目的基因的的秆。秆〉龌虻难粜钥寺∈.之间,表明该文库可以很好地用于目的基因的筛选。Ⅶ┗【鶩蜃槲目饽┒诵蛄蟹治从鳗弧菌基因组文库随机挑取隹寺〗兴┒瞬庑颍竦条序列。加上原有随机片断文库的跣蛄校不竦眯蛄凶艹,约占基因组的.%。对这些序列进行如下分析:首先,比对结果表明在条序列中,有跣蛄杏胧菘庀钟的序列有明显的相似性疾庑蜃苁ァ榷越峁与菘庑蛄邢嗨频挠条;与菘庀嗨频挠条。其次,根据文库的比对结果及相关文献资料,预测出与毒力相关的基因个,分别为溶血素基因觯馗葱蛄卸舅鼗个,鞭毛基因觯菌毛基因觯鞍酌富个。⒋喻┗【鶩蜃槲目饪寺从鳗弧菌基因组文库筛出含有基因的克隆,经玫絘ɑ颉8没蛉ǔ,编码霭被岵谢幸个个氨基酸残基的信号肽。分子量为,。鳗弧菌的蛋白编码序列与其他细菌的同源,序列相似性在%ァ。主要结果如下:
活性下降,溶血活性下降,毒力与野生型相比下降了两个数量级,因此蠡虻目寺〖凹从鳗弧菌基因组文库克隆基因,该基因序列全长,编码霭被幔肿恿吭9菇薖虿迦胧Щ钔槐渲昙捌浠ゲ怪辍基因缺失后,生长能力有所下降,细菌的明胶酶活性、阴R黄咸烟前访因对鳗弧菌毒力有明显的作用。关键词:鳗弧菌;文库;文库测序;毒力因子;基因克隆;基因功能鉴定
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学位论文作者签名:【┳秩掌冢喝珥谕谡既学位论文作者签名:分坪签字日期:侥甓嘣日独创声学位论文版权使用授权书明他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含未获得《蓬嵫≈。与我一同工本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权学校可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同时授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》,并通过网络向社会公众提供信息服务。C艿难宦畚脑诮饷芎笫视帽臼谌ㄊ导师签字:签字日期:年月日
第一章文献综述第一节微生物基因组学研究⑸锘蜃檠芯糠椒模式微生物基因组的研究年,炔捎萌ɑ蜃樗婊庑蚍晒Φ赝瓿闪肆鞲惺妊8司ɑ蜃樾蛄测定和组装,为微生物基因组研究揭开了历史性的新的一页V笮矶辔⑸锏男蛄邢嗉瘫徊舛ǎú≡⑸,⒅匾5墓ひ滴⑸,约疤殊环境下生活的微生物龋籏等。截止至年拢丫瓿苫蜃樾蛄胁舛ǖ奈⑸锎镏个,正在测序的有年在开展人类基因组计划的同时,也启动了模式生物基因组计划,其目的在于利用模式生物基因组与人类基因组之间编码顺序和组织结构上的同源性,用单一或简单的生物模式阐明高等生物特别是人的基因在结构、功能以及物种进化上的内在联系,因而模式生物序列测定后,人们都用实验的方法对它们进行了深入的研究。如酿酒酵母的基因组序列于年完成后,年等采用⒄罅屑际酰治鼋湍冈谄咸烟桥嘌嫌裳嵫转向有氧代谢的二次生长转型中,对环境变化的基因表达,结果不仅描绘出代谢途径中已知功能基因表达水平的变化,还观察到许多未知功能基因表达模式的变化,S秩月,大肠埃希菌耐整基因图谱绘制成功,基因组全序列完成,全长为灿龌颍也搞清了所有基因产物的氨基酸序列,%的基因功能得到了阐明,甜,;海痺../.。。,
最小基因组研究比较基因组学研究的研究,即一个能营独立生活的生物体最少需要多少个基因。目前研究最小基因籋等对种г生殖道支原体随着许多生物体全基因组测序的完成,兴起了最小基因组组的手段主要是插入基因突变和同源重组删除基因分析。由于支原体是已知的基因组最小的微生物,因而是最小基因组研究的重要材料,.扔萌砑分比较了生殖道支原体和流感嗜血杆菌的编码蛋白基因,认为龌蚩梢宰槌上赴懒⑸嫠匦氲淖钚』蜃籌奄;用鲇醒≡癖曛镜淖W铀婊迦氲娇莶莞司基因组中,分析实验