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扬子鳄基因组bac文库及mhcⅰ类基因bac克隆重叠群的构建.pdf

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文档介绍

文档介绍:中文摘要扬子鳄俏夜赜械恼湎”粑R吧铮て谝岳矗于人类的捕杀和栖息地的丧失,其野外种群的数量已不足酢NA吮;ふ庖珍稀濒危物种的基因资源,本论文以长兴扬子鳄自然繁育研究中心提供的血液样品为材料,以细菌人工染色体T靥澹⒘烁呷萘康难镒遇蜃目狻M痹诨蜃锽文库的基础上,利用虳揭法等技术,构建了扬子鳄嗷蜃榈目寺≈氐海佣:笮U筂基因组的物理图谱构建,以及幕蜃榧苹裙ぷ鳎峁┝斯丶牟牧掀台。主要研究结果如下:孕孪恃R何2牧希胮载体,成功构建了扬子鳄的基因组细菌人工染色体目狻N目獍,鯞克隆,保存于着嘌迳稀>运婊羧〉个寺〗新龀宓泳检测,计算出文库的平均插入片段为,覆盖扬子鳄基因组约倍.%的空载体M保游目庵谢竦萌我坏タ奖椿蚨嗫奖囱子鳄基因的概率为.%。对锷窧文库分别可以得到鲅粜钥寺。骄慷阅够在文库中成功扩增到鲅粜钥寺。な盗怂ㄎ目饩哂薪细叩母盖率。擞甈文库筛选技术,建立了扬子鳄基因组目獾母咝筛选文库。该文库包括个超级库和超级亚库。任一引物或探针只需个从Γ纯纱覤文库中筛选到所需的阳性寺ü酆戏治鯣菘馔葱蛄械奶氐悖杓屏松缚獾募娌⒁物,通过优化引物最终得到了个初筛阳性克隆,并利用步移法得到了龀跎秆粜钥寺〉牟嘁硇蛄校杓屏对嗷的特异基因引物,对初筛克隆进行了进一步的确认,最终得到了锽克隆重叠群:①.、;②.、、和;③.;④.、浙江人学硕士学位论文
关键词:扬子鳄基因组目嗷克隆重叠群和浙江大学硕上学位论文..
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学位论文版权使用授权书逝婆太堂构送交本论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权逝江太堂浙江大学研究生学位论文独创性声明表或撰写过的研究成果,也不包含为获得浙江太堂或其他教育机构的学位或本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名:签字日期:年月本学位论文作者完全了解有权保留并向国家有关部门或机可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索和传播,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。C艿难宦畚脑诮饷芎笫视帽臼谌ㄊ导师签名:日浙江大学硕士学位论文
致谢感谢我的导师方盛国教授提供给我这样好的一个学习和锻炼的机会,无论是论文的选题、设计,还是实验过程都离不开方老师的悉心指导和帮助。感谢万秋红老师,在课题设计研究、实验指导和论文撰写修改等诸多方面给予的细心指导和帮助。感谢他们为我创造了良好的实验条件和研究环境,保证了实验工作的顺利开展,他们对我在学习和生活的教育,将令我终身受益,永生难忘感谢葛云法老师在我工作、学习和生活上所提供的各种帮助。感谢实验室朝夕相处的兄弟姐妹们,他们是博士生赵莎莎、陈艺燕、叶青、何珂、鹿博、陈礼诚;硕士生吴建会、类延乐、张培、荆伟、连虹、张鹦鹦、朱英、龚杰;已经毕业的曾长军博士、何陆平博士、潘慧娟博士、吴海龙博士;已经毕业的陈轩硕士、郭洋硕士;本科生焦阳和蒋静玲;武汉中科院水生所的连灏硕士、华东师范大学的韩军硕士以及安徽师范大学的硕士生倪小伟,使我度过了一段愉快而又难忘的美好时光。感谢长兴扬子鳄自然繁育研究中心的全体工作人员,感谢他们在样品采集中付出的辛勤劳动。还要感谢我的父母在生活等各方面给我的支持,使我可以全身心地投入论文工作中。最后,衷心感谢所有曾给予我关心、支持和帮助的老师、同学和朋友们王晓亮年抡憬笱濒危野生动物保护遗传与繁殖教育部重点实验室国家濒危野生动植物种质基因保护中心浙江大学硕士学位论文
第一章文献综述头掷嗟匚第一节扬子鳄的研究概况物种之一,D壳埃镒遇凇侗粑6参镏止拭骋坠襞佬懈畚泅,是我国特有的国家吨氐惚;野生动物,已被世界自然保护联盟红色名录列为极危级,同时,它是全球种鳄鱼中最为濒危的种类和世界上大型脊椎动物中处境最受威胁的约》斜涣腥敫铰糏物种。传统分类学依据形态特征将现存的种鳄划归为隹疲憾畚泅秤泠,共鍪,镒遇狝,并与密西西比鳄腥攵畚泅、钝吻鳄属中,并一直沿用至今。但是从,杲ㄒ将扬子鳄从蟹掷氤隼闯闪⑿率粢籆艨J迹泄匮镒遇姆类归属特别是和密西西比鳄的关系一直存在两种对立的观点。有一部分的学者研究认为扬子鳄与密西西比鳄在很多方面都非常相似,应该是归于同属的。例如大多数鳄类都栖息于热带、亚热带的淡水或海水中,唯独扬子鳄和密西西比鳄生活在温带的淡水中,它们都挖洞穴居和冬眠,以适应温带四季多变的气候,它们的吻短,前端圆钝,口闭合时,下颌的第四齿嵌入上颌的一个凹槽内使齿不外露,它们的染色体数相同液诵鸵彩窒嗨.,蒙锘Ш兔庖哐Ъ际跹芯肯执骣类亲缘关

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