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zj基因工程第章目的基因的合成完全版.ppt

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文档介绍

文档介绍:(优选)zj基因工程第章目的基因的合成完全版
1页,共54页,星期二。
基因工程主要是通过人工的方法分离、改造、扩增并表达生物的特定基因,从而深入开展核酸遗传研究或者获取有价值的基因产物。通常将那些已被或者准备要被分离、组文库构建的载体通常选装载量较大的λ-DNA或考斯质粒;对于大型基因组(如动植物和人类)需使用YAC或BAC载体
由于绝大多数真核生物的mRNA小于10 kb,因此用于cDNA文库构建的载体通常选质粒
上述几种载体的最大装载量如下:
质粒 15 kb
λ-DNA 25 kb
考斯质粒 45 kb
BAC 300 kb
YAC 400 kb
用于基因文库构建的受体则根据载体使用大肠杆菌或酵母菌
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重组DNA分子的构建
一般选择10uL的连接反应体系,其中DN***段与载体臂之间的摩尔数比为2:1
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重组DNA分子导入受体细胞
一般采用噬菌体颗粒的形式将重组DNA分子导入大肠杆菌细胞中,以提高建立基因文库的效率。
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基因文库的完备性
基因文库的完备性是指:在构建的基因文库中任一基因存在的概率,它与基因文库最低所含克隆数N之间的关系可用下式表示:
N = ln ( 1 – P ) / ln ( 1 – f )
其中: N:重组子的数量
P : 任一基因被克隆(或存在于基因文库中)的概率
f : 克隆片段的平均大小/ 生物基因组的大小
例如, x 109 bp,基因文库中克隆片段的平均大小为15 kb,;,基因文库至少需要180万个克隆
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基因文库的质量标准
除了尽可能高的完备性外,一个理想的基因文库应具备下列条件:
重组克隆的总数不宜过大,以减轻筛选工作的压力
载体的装载量最好大于基因的长度,避免基因被分隔克隆
克隆与克隆之间必须存在足够长度的重叠区域,以利克隆排序
克隆片段易于从载体分子上完整卸下
重组克隆能稳定保存、扩增、筛选
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基因文库的扩增、分装及保存
液体培养增殖法;
影印滤膜培养法;
制备转导性裂解物;
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第二节 cDNA基因文库构建
cDNA基因文库的概念

某种生物基因组转录的部分或全部mRNA经反转录产生的各种cDN***段分别与克隆载体重组,贮存在一种受体菌群体中,这样的群体称为cDNA文库。 如果此群体中只贮存该基因组cDNA部分,则称为部分cDNA基因文库。
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cDNA基因文库构建的步骤
细胞总RNA的制备及mRNA的分离
cDNA第一条链的合成
双链cDNA的合成
cDNA与载体的连接
噬菌体颗粒的包装
转染或质粒的转化
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mRNA
cDNA
双链cDNA
重组DNA分子
cDNA文库
反转录酶
载体
受体菌
复制
从cDNA文库获取目的基因
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尿素-***化锂法
硫***酸胍法
polyT亲和层析法
密度梯度离心分级法
探针筛选法
mRNA的提取与纯化
AAA
AAA
AAA
AAA
polyT
polyT
polyT
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从mRNA制备cDNA
逆转录酶
DNA聚合酶
mRNA
cDNA
杂化双链
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cDNA第一链的合成
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cDNA第二链的合成
自身引导法:获得的双链cDNA 5’端会有几对碱基缺失
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cDNA第二链的合成
置换合成法:获得的双链cDNA 5’端也会有几对碱基缺失
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cDNA第二链的合成
引导合成法:获得的双链cDNA 能保留完整的5’端序列
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双链平头的cDNA通常可以使用下列三种方法克