文档介绍：结构特点: 1. 含苯环: phe 2. 含酚羟基: Tyr 3. 含吲哚环: Trp 4. 含羟基:Ser Thr 5. 含硫: Cys Met 6. 含胍基:Arg 7. 含咪唑基: His 一、氨基酸的理化性质: ***电离***电离等电点等电点(pI (pI ) ) 在水溶液中能***电离而成兼性离子在水溶液中能***电离而成兼性离子分子呈电中性时的溶液的分子呈电中性时的溶液的 pH pH值值紫外吸收紫外吸收芳香族氨基酸特有芳香族氨基酸特有(phe (phe , , Tyr,Trp) Tyr,Trp) 吸收峰:波长吸收峰:波长 280nm 280nm 茚三***反应茚三***反应加热加热氨基酸氨基酸+ + 茚三***茚三***蓝紫色化合物蓝紫色化合物(570nm) (570nm) 氨基酸的定量方法氨基酸的定量方法二、蛋白质的空间结构定义维系键举例一级结构( primary structure ) (1 )多肽链中氨基酸(残基)的排列顺序。(2 )是蛋白质的基本结构。(3 )是空间结构、生理功能的基础。肽键(二硫键) 二级结构(second structure ) 多肽链中相邻氨基酸残基形成的局部肽链空间结构, 其主链原子的局部空间排布,并不涉及氨基酸残基侧链的构像。氢键超二级结构( super secondary structure ) 和结构域( domain ) 超二级结构(模体, motif ) 蛋白质多肽链上的一些二级结构单元,有规律地聚集起来,形成αα, βββ, βαβ, β 2α, α T α等结构基因表达调控中的转录因子(具备功能) (锌指,亮氨酸拉链、αT α、β 2α) 结构域( domain ) 单个或多个超二级结构进一步集结形成在蛋白质分子空间结构中可明显区分的区域脱氢酶蛋白、细胞膜受体蛋白三级结构(tertiary structure) 在二级结构的基础上, 包括相距较远的氨基酸残基及其侧链R 基团形成的整个多肽链的空间构象。特点: 为球状或者为椭圆状蛋白质, 具有生命活性,可形成亲水表面和疏水内核。疏水键肌红蛋白免疫球蛋白四级结构(quaterna ry stucture) 指几个各具独立三级结构的多肽链之间的相互集结, 并以特定的方式接触, 排列形成更高层次的大分子空间构象亚基: 1. 具备三级结构,单独存在无活性 2. 存在于四级结构中亚基间以盐键相连 Hb 血红蛋白蛋白质结构与功能的关系举例一级结构 1 、一级结构不同,功能不同 2 、一级结构相同,功能相同 3 、一级结构中非关键部位氨基酸残基发生变化,不影响生物活性。 4 、一级结构中关键部位氨基酸残基发生变化,可导致功能变化。 1. 非关键部位: 人、猪、牛胰岛素 2. 关键部位: 镰刀型细胞贫血症(β链 N 端第 6 个氨基酸为 Glu 突变为 Val ) HbS 携氧能力下降, 缺氧时 RBC 呈镰刀状, 脆性增加,溶血空间结构特定功能,特定构象: α- 螺旋: 指甲/ 毛发中角蛋白;π螺旋: 肌腱/ 皮肤中胶原蛋白β- 片层: 蚕丝中丝心蛋白; 离子通道α螺旋主链右手螺旋(单链) 主链右手螺旋(单链) , 13 13 螺旋螺旋氢键方向与螺旋纵轴平行,链内氢键是氢键方向与螺旋纵轴平行,链内氢键是αα螺旋稳定的主要因素螺旋稳定的主要因素侧链基团位于螺旋外,不参与的组成,但对螺旋的形成与稳定有影响侧链基团位于螺旋外,不参与的组成,但对螺旋的形成与稳定有影响αα螺旋稳定蛋白质空间构象螺旋稳定蛋白质空间构象β折叠: 伸展的肽链结构伸展的肽链结构肽键平面之间折叠成锯齿状,相邻两平面呈肽键平面之间折叠成锯齿状,相邻两平面呈 110 110 度度结构的维系依靠肽链间的氢键,氢键的方向与肽链长轴垂直结构的维系依靠肽链间的氢键,氢键的方向与肽链长轴垂直肽链的肽链的 N N 末端在同一侧末端在同一侧--- --- 顺向平行,反之为反向平行。顺向平行,反之为反向平行。β转角: 肽链出现肽链出现 180 180 ° ° 转回折的转回折的““U U””结构结构由第由第 1 1 个氨基酸残基的个氨基酸残基的 C=O C=O 与第与第 4 4 个氨基酸残基的个氨基酸残基的 N-H N-H 形成氢键,中间包括形成氢键,中间包括 10 10~ ~1 12 2 个原子, 个原子, 较较αα螺旋紧密螺旋紧密常位于球蛋白分子表面,为蛋白质活性的重要空间结构部分常位于球蛋白分子表面,为蛋白质活性的重要空间结构部分π螺旋: 左手螺旋左手螺旋 18 18, , 氢键维系螺旋稳定氢键维系螺旋稳定多见于多见于胶原蛋白胶原蛋白, ,3 3 股左手螺旋盘绕形成右手超螺旋后转变为股左手螺旋盘绕形成右手超螺旋后转变为胶原纤维胶原纤维无规则卷曲: 是蛋白质中一系列无序构象的总称