文档介绍:第二节蛋白质一级结构的测定方法演示文稿
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优选第二节蛋白质一级结构的测定方法
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由于克隆核苷酸序列比测定核苷页,共84页,星期日。
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③ Cleland‘s试剂的还原作用
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稳定SH基的方法:
(A) 烷基化试剂使SH基转变为稳定的硫醚衍生物
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稳定SH基的方法: (B)氨乙基化
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非共价结合
尿素, SDS-PAGE,盐酸胍, 高浓度的盐
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2)末端分析
(1)N-末端测定
A. 二硝基***苯法(FDNB,DNFB)
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(1)N-末端测定 B.***酸盐法异硫***酸苯酯(PTC或PITC)与N末端的α-氨基发生的反应,生成PTC-钛,在弱酸中自发环化转变成PTH-衍生物。该试剂称为Edman试剂。 由于PTH-衍生物从多肽链上脱落下来对其余部分没有影响,所以常用来测定蛋白质的一级结构。
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(1)N-末端测定 ***氨基萘磺酰***法
在碱性条件下,丹磺酰***(二甲氨基萘磺酰***DNS-Cl)可以与N-端氨基酸的游离氨基作用,得到丹磺酰-肽。
此法的优点是丹磺酰-氨基酸有很强的荧光性质,检测灵敏度可以达到110-9mol。
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氨肽酶法
氨肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链的N-端逐个的向里水解。根据不同的反应时间测出酶水解所释放出的氨基酸种类和数量,按反应时间和氨基酸残基释放量作动力学曲线,从而知道蛋白质的N-末端残基顺序。
最常用的氨肽酶是亮氨酸氨肽酶,水解以亮氨酸残基为N-末端的肽键速度最大。
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2)末端分析(2)C-末端分析
无水肼NH2NH2 100℃ 5-10h。
苯甲醛沉淀氨基酸的酰肼,C端游离氨基酸留在上清中。
Gln(谷氨酰***)、Asn(天冬酰***)、Cys(半胱氨酸)、Arg(精氨酸)不能产生游离的羧基末端aa。
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(2)C-末端分析
羧肽酶可以专一性地水解羧基末端氨基酸。根据酶解的专一性不同,可区分为羧肽酶A、B和C。应用羧肽酶测定末端时,需要事先进行酶的动力学实验,以便选择合适的酶浓度及反应时间,使释放出的氨基酸主要是C末端氨基酸。
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羧肽酶法测
C 末端
羧肽酶法
羧肽酶A:
除Pro、Arg(精氨酸)、Lys(赖氨酸)外的所有C端氨基酸
羧肽酶B:只水解Arg、Lys
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C-末端分析C. C-端氨基酸选择性氚标记法:
使用氚标记是测定C-端氨基酸最好的办法,专一性强,灵敏度高,但是这种方法不能用于C-端脯氨酸(Pro)和天冬氨酸(Asp)
还原法:利用硼氢化锂将C-端氨基酸还原成-氨基醇。然后碱多肽水解,用色谱法鉴定-氨基醇的类别。
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酸水解
常用6 mol/L的盐酸或4 mol/L的硫酸(磺酸)在105-110℃条件下进行水解,反应时间约20小时。近年来用4 mol/L的***磺酸代替盐酸,效果比较好,被广泛应用。
此法的优点是不容易引起水解产物的消旋化。
缺点是色氨酸被沸酸完全破坏,含有羟基的氨基酸如丝氨酸或苏氨酸有一小部分被分解;天门冬酰***和谷氨酰***侧链的酰***基被水解成了羧基。
-COO+
3)氨基酸组成分析
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碱水解
一般用5 mol/L氢氧化钠于真空或充氮条件下进行,1100C煮沸10-20小时。
由于水解过程中许多氨基酸都受到