文档介绍:分子克隆实验基本流程
根据生物信息学方法找到自己要克隆的目标蛋白基因序列,设计引物交给生物公司合 成,同时准备好模板(cDNA库或者plasmid收到引物后按照说明书处理引物,然后就可 以PCR目标蛋白的基因了。
PCR 体系(50 微分子克隆实验基本流程
根据生物信息学方法找到自己要克隆的目标蛋白基因序列,设计引物交给生物公司合 成,同时准备好模板(cDNA库或者plasmid收到引物后按照说明书处理引物,然后就可 以PCR目标蛋白的基因了。
PCR 体系(50 微升):primerstar premix 25 微升
Upstream primer 1 微升
Downstream primer 1 微升
模板(template ) 1微升
ddH2O 22 微升
说明:生物公司提供的primerstar premix是预混好的,浓度是2*的,其中包含了 DNApok dNTP、Mg?+等(具体可以看说明书)。模板浓度不需要特别高,因为PCR可以检测到痕量 的DNA。注意:对于含primerstar premix的样品尽量在冰上操作,防止其中的酶变性失 活。另外在PCR小管中添加各成分时请集中注意力,不要错加漏加,尽量不要说话,保 持清洁的环境,避免污染等。
PCR结束,取少量PCR产物进行核酸电泳:1 %琼脂糖核酸胶( agrose+30ml 1*TAE)
凝胶成像仪看电泳结果:1、没有目标条带,分析原因:退火温度Tm不合适?引物加 错了没有或者少加了?。。。退火温度Tm可以再次拉梯度PCR等
2、 条带不够亮:确定电泳loading buffer没有问题时可以以PCR
产物为模板再次PCR,或者增加循环次数,一般PCR30个循环,可以增加到35个循环等。
3、 PCR条带很亮:切胶回收(有杂带时)或者无胶回收(目 标条带单一很纯很亮时)模板条带。(根据回收试剂盒说明书操作即可)
酶切目标基因和载体(露出粘性末端,便于与载体接合)
体系(30微升):需要酶切的基因/
酶1 1微升
酶2 1微升
10*buffer计算获得
ddH2O 计算获得
说明:1、这个体系并不是固定的,各种成分的量可以变动,如可以多加一些需要酶切 的基因,但是为了保证酶切效果一般不会过多添加需要酶切的基因/载体,而是会变动酶的 量。不同的酶需要的buffer不同,对于buffer的浓度不同(具体参照说明书)。一般过夜酶 切效果好。注意酶切的温度!
2、根据平时的实验,载体相对基因更难以切开,因此可以适当增加酶的量,比 ;延长酶切时间,如过夜;另外还可以在酶切一段时间后再次添加酶继续酶切 一段时间。实验证明最后一种方法比较好用。
无胶回收酶切好的基因/载体
将酶切好的基因和载体链接。
体系(10微升):
5 微升 solution I
一般16度水浴锅过夜连接效果较好,也快根据说明说操作。
将连接产物转化到克隆菌株(如TOPIO, DH5a)中,目的是或者大量扩增的目标质 粒。
操作步骤:从超低温冰箱中取出感受态菌,冰中放置5min (复苏)一加入全部的连接 产物,冰中放置30min-42度水浴热击90秒,冰中放置5min一加入500微