文档介绍：This template is the internal standard courseware template of the enterprise
Bioedit使用说明书
BioEdit简介
BioEdit是一个性能优良的辑、增加或者删除。想要编辑或删除一个现存的特征，在“Features”下拉式菜单中选择特征，并点击合适的按钮。点击“Add New” 按钮，可以增加一个新的特征。
　　现在只有一个圆形、单链质粒是有效的。在以后的版本中中将会改进。
　　“Font”按钮改变指示的默认字体。特征标记的字体将可以单独改变，但是位置标记不能单独改变。
二、Restriction Maps(限制性内切酶图)
BioEdit提供两种方法产生核苷酸序列的限制性内切酶图。一种内在的限制性内切酶图功能允许产生序列最多为65,536个核苷酸的限制性内切酶图。实际上，只能检测大约35Kb，而且在速度慢的计算机上会要消耗很长的时间。
　你也可以通过万维网直接链接到WebCutter 限制性内切酶图上。
：
点亮你想要图谱的序列标题，从“World Wide Web”菜单中选择“Auto-fed WebCutter Restriction Mapping”
: 点亮你想要图谱的序列标题，从“Sequence” 菜单选择“Restriction Map” 。以下选项将会显示在一个界面窗口：
— 显示图谱：显示或省略序列的全图谱,：yes
—按照字母顺序排列名称：显示关于所有内切酶、它们的识别序列、切割频率和所有位置(5’末端开始是1) ：yes
—位置数：：no
—唯一位点列表：：no
—切割5次或更少的酶 .默认值：yes
—频率汇总表：关于所有正确选择的内切酶和它们切割序列的次数。默认值：no
—不能切割的内切酶。默认值：yes
— 4-碱基内切酶：想要包括这些酶,：no (不包括本身)
— 5-碱基内切酶：与4-base cutters相同.
—非严格识别序列的酶：：yes
—大的识别位点：通常用于克隆,只有共同的6-碱基识别酶被使用.
—同裂酶：若只显示一个特殊识别位点的一个内切酶,不选(默认值=不选择).
—翻　　译：显示沿着排列中的序列翻译(5’端到3’端的由左到右的翻译)
—互补翻译：互补链的翻译方向相反.
—编号方式：是酶切位点的核酸的号码,而不是识别位点的起点.
Enzyme Browser (限制性内切酶浏览器 )
从核酸序列中得到内切酶谱时，显示酶的生产公司是很有用的。通过在内切酶图谱中选择制造厂商和按下按钮，可以手动浏览内切酶。你也可以通过选择“Options ”菜单中的“View Restriction Enzymes by Manufacturer”选择，在任何时候检查内切酶。显示如右对话框：
在这个例子中，所有来源于Stratagene的限制性内切酶显示在左边的列表中，KpnI的亮度增加。KpnI的识别序列显示在顶端，同裂酶显示在它的下方，其他提供KpnI的公司显示在同裂酶的下方。BioEdit使用ReBase提供的gcgenz表，限制性内切酶数据在万维网的地址是：。可以从ReBase 下载最新的gcgenz 表，将其命名为“”，并且替代在BioEdit安装文件夹中“tables ”目录下的旧文件。
　　注意：表必须是gcgenz格式的。你可以从tables文件夹中打开“ ”文件查看格式，或者查看“Restriction Maps ”。限制性内切酶表格文件名必须是“ ”，而且必须在BioEdit的“tables ”文件夹里。

从“Sequence” 菜单下进入“Protein”, 再进入“amina acid composition”, 可对序列的氨基酸组成分析，结果以摘要和图例的形式给出。
　　图例中的柱形条表示每种氨基酸在序列中的摩尔比，如下图：
三、蛋白质分析
以RGDV的minor outer capsid protein－AAS66885为例：

在联配文件中有专栏用熵图来衡量可变性。它衡量的是在联配中每个位置的“信息量”的缺乏。准确地说，是每个位置的可预测性的缺乏。