文档介绍：第五章
用SHELXTL程序
进行结构分析的方法
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edit .res
edit .ins
edit .cif
edit .prp
edit .lst
copy .res→.ins
Xl
XH
一、SHELXTL文件
1. 文件名
一般,同一结构,所有文件都用相同的名(不能超过8个字符),只是扩展名不同
2. 两个必要文件(由XPREP程序产生)
*.hkl文件: 所有的衍射点,每一点一行。
格式为:h k l F2 σ(F2)
-4 2 -2
4 -2 2
-4 -2 -2
-4 -2 -2
…………………………………..
*.ins 文件:组成上可分成五部分
TITL 041203e in P2(1)/c
CELL
ZERR
LATT 1
SYMM -X, +Y, -Z
SFAC C H N O Co S
UNIT 108 104 40 20 8 16
信息区
SIZE
HTAB 2
. 8
ACTA
BOND
FMAP 2
PLAN 20
晶胞参数
X光波长
标题
空间群
单胞中
分子数目
晶胞参数的标准偏差
晶格类型
对称操作码
原子类型
单胞中
原子数目
命令区
可输入各种让XS和XL执行的命令
DFIX o5 c27
WGHT
FVAR
TEMP 25
Co1 5 = - -
Co2 5 = -
N1 3 = - -
N2 3 = -
………………………………………………………………….
命令区
HKLF 4
END
原子表
坐标、占有率、温度因子
衍射点文件类型
文件结束命令
res
lst
plt
cif
fcf
pcf
tex
xs、xl、refine产生的文件
记录xs、xl、refine过程和结果的文件
XP中做的图形文件
晶体学信息文件
结构因子文件
晶体结构报表文件
记录仪器型号、晶体外观等的文件
结构解析和精修的过程,是ins文件建立和不断更新的过程,这主要是下列过程实现的:
xprep、xshell—refine、xl、xp、edit、copy
SHELXTL的主要子程序和文件
二、常用的XS和XL指令
指令
含义
ACTA
产生cif文件
AFIX
将原子坐标强制性地固定在指定位置上,
或在指定位置上产生原子
ANIS
将各向同性换成各向异性精修
BOND
计算键长、键角(加$H包括H的键长、键角)
BIND
计算指定原子对的键长、键角
CONF
计算扭转角
DELU
限制指定原子具有相似的位移参数
DFIX
限定指定原子对间的距离
EADP
给两个或多个原子指定相同的位移参数
指令
含义
END
指令输入结束
EQIV
提供分子内或分子间键合原子的对称操作码
ESEL
限制E值的下、上限
EXTI
对晶体消光效应参数进行精修
EXYZ
让两个或多个原子具有相同的坐标
FLAT
限制指定原子在相同的平面上
FMAP
所计算Fourier图的类型
FREE
不计算指定原子对的键长、键角
FVAR
全比例系数
HFIX
限制H原子在理想位置上