文档介绍：第二部分蛋白质的三维结构
第一节蛋白质三维结构概述
第六节蛋白质的变性与复性
第二节蛋白质二级结构
第三节蛋白质超二级结构和结构域
第四节球状蛋白质与三级结构
第五节蛋白质的亚基缔合与四级结构
第一节蛋白质三维结构概述
一、蛋白质三维结构的形成原因
蛋白质三维结构决定于三个因素(P197):
与溶剂分子(一般是水)的相互作用。
溶剂的PH和离子组成。
蛋白质的氨基酸序列。
?
氨基酸的成肽反应:
1. 一般的C-N单键> 肽键C-N > 一般的C=N双键。
( Å) (Å) (Å)
因此肽键具有部分双键的性质,不能沿C-N自由旋转。
2. C=O和NH2中的O原子与H原子成反式排列。
(一)肽键的特点: (P204-206)
Cα
Cα
Cα
C-N肽键:具有部分双键的性质,不能沿C-N自由旋转。
N-Cα键: 旋转角为φ
C-Cα键: 旋转角为ψ
可以自由旋转
φ和ψ称为<二面角>
3. 与C-N键相连的N-Cα和Cα-C可自由旋转,旋转角分别为φ和ψ。
ψ: Psai / Psi
ψ
φ
因为肽键不能自由旋转,所以肽键中的四个原子:C、O、N、H和它相邻的两个Cα处于同一平面,形成酰胺平面(肽单元,肽平面)。
(二)肽单元 (P204-206)
两个相邻的肽单元
φ,ψ:“二面角”
φ,ψ代表了两个相邻肽单元(肽平面)之间的可以自由旋转的角。