文档介绍：微生物多样性分析需求登记表
高通量测序平台
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1、客户基本信息
单位/姓名
联系方式
E-mail:
课题组/导师
研究方向
2、样品信息
样本来源
□人体微生物: 肠道( ) 口腔( ) 皮肤( ) 鼻咽( )
□动物:粪便( ) 组织( ) 瘤胃( )
□环境微生物: 土壤( ) 水源( )活性淤泥( )
□食品微生物乳制品( ) 风味发酵品(如泡菜)( )
□培养物有机肥( ) □其他:______
样品类型
DNA ( ) 未处理的实验样本( )
样本数量
10个以下( ) 10到30 ( ) 其他:
3、实验设计
测序平台
□ Illumina Miseq 2*300bp (推荐平台)
□ Roche 454 FLX+( ) (费用较高)
研究对象的生物学分类
原核生物16S ( ) 真核生物 18S ( ) 真菌 ITS ( )
古菌( ) 功能基因:氨氧化细菌AOA( ) 氨氧化古菌AOB( )
反硝化菌(narG、nirK/nirS、nosZ)( ) 硫酸盐还原菌SRB( )
其他(____)
研究区域
请参考附件表格填写。
参考文献方案
客户如有中意的相关文献,可提供给我们,便于我们评估能否重复其方案。
注:1、本表各项内容请务必认真填写,以免由于信息缺漏或错误给您实验造成影响;
2、请将电子版表格发送至******@.或打印后随同样品一起寄送。
3、如有疑问,欢迎来电。 021-31606760/31606761 400电话/企业QQ:400-660-9270
附件:不同引物区域参考
鉴定物种
目标区域
长度
引物序列
细菌
16S rDNA
单V区 V3
180bp
357F/533R
细菌
16S rDNA
单V区 V4
300bp
515F
/806R
细菌
16S rDNA
双V区 V1-V2
330bp
8F/338R